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J-GLOBAL ID：201502210651864180   整理番号：15A1174471

SRAPマーカーに基づく中国のCymbidium生殖質の遺伝的多様性解析と分子同定カード構築【Powered by NICT】

Genetic Diversity Analysis and Molecular Identification Card Construction of Chinese Cymbidium Germplasms Based on SRAP Markers

著者 (3件)： Tang Yuanjiang (Inst. of Flower Engineering, Huaqiao Univ., Fujian, Xiamen) ,  Cao Wenjing (Inst. of Flower Engineering, Huaqiao Univ., Fujian, Xiamen) ,  Wu Kunlin (South China Botanical Garden, Chinese Acad. of Sciences, Guangzhou)
資料名： Zhongguo Nongye Kexue  (Zhongguo Nongye Kexue)
巻： 48  号： 9  ページ： 1795-1806  発行年： 2015年 
JST資料番号： W1459A  ISSN： 0578-1752  CODEN： CKNYAR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】中国シンビジウム生殖質の遺伝的多様性を研究した,一方,分子フィンガープリント法とIDカードは分子レベルでのそれらの同定のための技術支援を提供し,今後の開発,保存,利用と革新のための根をlaytheするために確立した。〔方法〕栽培および野生種を含む中国シンビジウムgemplasmの139試料を中国南部とその近傍から採取した。それらのゲノムDNAはCTAB改良法によって抽出した。208対SRAPプライマーは,13個のランダム組合せであったFプライマーと16Rプライマー,SRAPプライマーの各対は最初に「Daxun」から二品種のゲノムDNAからの特定の製品,「Songmei」からの増幅のためのスクリーニングした。PCR増幅産物は6%非変性polyacrylamidegel電気泳動で分離した。電気泳動パターンは人工的に解析し,全バンド,多型バンドと多型バンド(PPB)の割合を計数した。多型情報含有値(PIC)はBotsteinの式に従って計数した。対立遺伝子(Na),対立遺伝子の有効数(Ne),Neiの遺伝的多様性多様性指数(H),及びShannonの情報指数(I)の観察された数はすべてのソフトウェアPOPGENE32により推定した。UPGMAクラスター分析は,ソフトウェアNTSYS pc2 10eによって行った,遺伝的類似性係数値を達成した。プライマー組合せの方法を用いて,中国のシンビジウム生殖質の139試料のデジタルフィンガープリントを構築した。〔結果〕208対SRAPプライマーから選別された17対多型プライマーと,合計489バンドがこれらのプライマーにより増幅し,その内の484バンドが多型とPPBは98.89%であり,対立遺伝子(Na),対立遺伝子の有効数(Ne),Neiの遺伝的多様性多様性指数(H),及びShannonの情報指数(I)の観察された数は,それぞれ2.00;1.49;0.30;0.45であった。139種類の中国産シンビジウム0.51から0.91の範囲であり,UPGMAに基づくクラスタ分析の遺伝的類似係数はこれらの生殖質は類似性係数0.70で六の主要グループに分けられることを示した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 対立遺伝子 ,  *中華人民共和国 ,  プライマ【塗装】 ,  *遺伝 ,  品種 ,  類似性 ,  バンド ,  脂肪族アミン ,  第四アンモニウム
準シソーラス用語： 遺伝的類似性 ,  多様性指数 ,  ゲノムDNA ,  野生種 ,  *遺伝多様性 ,  *生殖質 ,  *SRAP , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 集団遺伝学  (EC01040J)

物質索引 (1件)： セチルトリメチルアンモニウムブロミド

タイトルに関連する用語 (10件)： SRAP ,  マーカー ,  中国 ,  Cymbidium ,  生殖質 ,  遺伝的多様性 ,  解析 ,  分子同定 ,  カード ,  構築