Data2Dynamics:ダイナミックシステムのパラメータ推定に適合するモデリング環境

RAUE A.; STEIERT B.; SCHELKER M.; KREUTZ C.; MAIWALD T.; HASS H.; VANLIER J.; TOENSING C.; ADLUNG L.; ENGESSER R.; MADER W.; HEINEMANN T.; HEINEMANN T.; HASENAUER J.; HASENAUER J.; SCHILLING M.; HOEFER T.; HOEFER T.; KLIPP E.; THEIS F.; THEIS F.; KLINGMUELLER U.; SCHOEBERL B.; TIMMER J.; TIMMER J.

文献

J-GLOBAL ID：201502210851639122 整理番号：15A1311995

Data2Dynamics:ダイナミックシステムのパラメータ推定に適合するモデリング環境

Data2Dynamics: a modeling environment tailored to parameter estimation in dynamical systems

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資料名：
巻： 31 号： 21 ページ： 3558-3560 発行年： 2015年11月01日
JST資料番号： T0478A ISSN： 1367-4803 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：短報発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

大きなデータセットと複雑な実験条件のために,生化学反応ネットワークのダイナミックモデルを構築し,モデルフィッティングのためにパラメータ推定を実行する環境が提示された。微分方程式,および,付随する感受性システムを解くような部分は,並列化され,自動的に効率的なCコードに集められた。Data2Dynamicsには,種々のパラメータ推定アルゴリズム,ならびに不確実性分析のための頻度論的方法(frequentist法)およびベイズ法が実装され,出版につながる適用範囲で使用された。Data2Dynamicsは,http://www.data2dynamics.org/で入手可能である。

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細胞生理一般 , 計算機シミュレーション

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