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J-GLOBAL ID：201502211604889295   整理番号：15A0810176

細菌ドメインの15%以上を構成する細菌群に見られる独特の生物学的特性

Unusual biology across a group comprising more than 15% of domain Bacteria

著者 (11件)： BROWN Christopher T. (Univ. California, Berkeley, California, USA) ,  HUG Laura A. (Univ. California, Berkeley, California, USA) ,  THOMAS Brian C. (Univ. California, Berkeley, California, USA) ,  SHARON Itai (Univ. California, Berkeley, California, USA) ,  CASTELLE Cindy J. (Univ. California, Berkeley, California, USA) ,  SINGH Andrea (Univ. California, Berkeley, California, USA) ,  BANFIELD Jillian F. (Univ. California, Berkeley, California, USA) ,  WILKINS Michael J. (Ohio State Univ., Ohio, USA) ,  WRIGHTON Kelly C. (Ohio State Univ., Ohio, USA) ,  WILLIAMS Kenneth H. (Lawrence Berkeley National Lab., California, USA) ,  BANFIELD Jillian F. (Lawrence Berkeley National Lab., California, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 523  号： 7559  ページ： 208-211  発行年： 2015年07月09日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細菌ドメインの顕著な特徴の1つは,代表種が単離されていないという理由で門の候補として扱われている複数の主要な系統が1つの放散を構成していることである。これらの門の細菌はさまざまな環境に存在しており,炭素および水素の循環を介在していると考えられている。少数の代表種のゲノム解析からは,代謝の制約が培養を妨げていることが示唆されている。今回我々は,35を超える門を代表する細菌から8例の完全ゲノムおよび789例の概要ゲノムを再構築し,これらの細菌を他の細菌から一貫して識別するための特徴を示す。細菌ドメインの15%以上を構成すると考えられるこの群は,同じ進化史を共有すると推測されたことから,我々はこれをCandidate Phyla Radiation(CPR)と称する。CPRゲノムは全て小型であり,大半のものは多くの生合成経路を欠いている。16SリボソームRNA(rRNA)遺伝子の塩基配列は多様であるため,特定の複数の門から標本抽出した細菌の50~100%は,典型的な培養非依存型の調査では検出できないと考えられる。CPR細菌は,自己スプライシングするイントロンおよびタンパク質がrRNA遺伝子内にコードされているものが多いが,これは細菌でほとんど報告例のなかった特徴である。さらに,CPR細菌はリボソームの構成も独特である。全てのCPR細菌は,共生細菌に存在しないことの多いリボソームタンパク質を持たず,特定の系統には,細菌に普遍的と考えられていたリボソームタンパク質や生合成因子が認められない。このことは,異なるリボソーム構造および生合成機構の存在を意味しており,細菌ドメインの大きな部分には独特の生物学的特性があることを明確に示している。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： *細菌 ,  ゲノム ,  *rRNA遺伝子 ,  系統樹 ,  ヌクレオチド配列 ,  イントロン ,  *リボソームタンパク質 ,  リボソーム ,  トランスクリプトーム ,  認識 ,  遺伝学 ,  GTPアーゼ ,  クエン酸サイクル ,  複合酵素系
準シソーラス用語： 細菌ゲノム ,  *16S rRNA遺伝子 ,  識別 ,  メタゲノム解析 ,  電子伝達複合体

分類 (1件)： 微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C)

タイトルに関連する用語 (3件)： 細菌 ,  ドメイン ,  生物学的特性