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J-GLOBAL ID：201502211863232482   整理番号：15A0978800

家畜の改良・増殖におけるICT活用への期待 2 ウシ育種におけるビッグデータの活用

著者 (1件)： 林武司 (中央農業総合研究セ)
資料名： 畜産技術  (Livestock Technology)
号： 723  ページ： 23-28  発行年： 2015年08月01日 
JST資料番号： Y0328A  ISSN： 0389-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 牛の全ゲノム配列を参照として,異なる品種および個体のゲノム配列との比較により,品種や個体を特徴づける多数のSNP(一塩基多型)が特定され,米国の乳牛では,7万頭を超える個体についての多数のSNPの遺伝子型と形質の表現型情報(従来の家計情報を用いた育種評価値)が収集されている。ゲノミックセレクション(GS)では,SNP遺伝子型のデータと表現型のデータを備えた多数の個体からなる集団(トレーニング集団)をもとに,SNPから育種価を予測する予測モデルを構築し,選抜集団の中の各個体のSNP遺伝子型データから計算したゲノム育種価の高い個体が迅速に選抜される。乳牛においては,すでにアメリカ,カナダなどでGSを活用した育種が行われ,肉牛への適用も示唆されている。

シソーラス用語： *ウシ ,  家畜育種 ,  *分離育種 ,  *一塩基多型 ,  *DNAマーカー ,  *遺伝子型 ,  表現型 ,  *育種価 ,  予測技法 ,  予測モデル ,  不偏推定 ,  Bayes推定 ,  集団 ,  DNAマイクロアレイ
準シソーラス用語： GBLUP法 ,  *ゲノム育種価

分類 (2件)： 牛  (FD02020Y) ,  飼育動物の育種  (FD01020R)

引用文献 (14件)：

• Bovine Genome Sequencing and Analysis Consortium. 2009 The genome sequence of taurine cattle: a window to ruminant biology and evolution. Science 324:522-528.
• Garrick, D.J. 2011 The nature, scope and impact of genomic prediction in beef cattle in the United States. Genetics Selection Evolution, 43:17.
• Habier, D., R.L. Fernando, K. Kizilkaya and D.J. Garrick 2011 Extension of the bayesian alphabet for genomic selection. BMC Bioinformatics 12:186.
• Imai, K., T. Matsughige, T. Watanabe, Y. Sugimoto, and N. Ihara. 2007 Mapping of a quantitative trait locus for beef marbling on bovine chromosome 9 in purebred Japanese black cattle. Animal Biotechnology 18:75-80.
• Kemper, K.E. and M.E. Goddard. 2012 Understanding and predicting complex traits: knowledge from cattle. Human Molecular Genetics 21:R45-R51.

タイトルに関連する用語 (8件)： 家畜 ,  増殖 ,  ICT ,  活用 ,  期待 ,  ウシ ,  育種 ,  ビッグデータ