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J-GLOBAL ID：201502214002633167   整理番号：15A1311976

Proteny プロテオームレベルにおける統計的に有意なシンテニークラスタの発見および可視化

Proteny: discovering and visualizing statistically significant syntenic clusters at the proteome level

著者 (2件)： GEHRMANN Thies (Delft Univ. Technol., Delft, NLD) ,  REINDERS Marcel J.T. (Delft Univ. Technol., Delft, NLD)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 21  ページ： 3437-3444  発行年： 2015年11月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 発散ゲノム間においてシンテニーを検出する方法,Protenyを示した。Protenyは,ゲノム間のゲノミクス規則化において多様性を取り扱う順序を無視するエキソンのコドン利用適応およびクラスタグループに非感受性であるようにアミノ酸配列において作動する。さらに,Protenyは,統計的基盤において選択されるようにシンテニークラスタへ有意水準を帰属させる。最終的に,Protenyは異なるスケールにおいて結果を可視化する新規方法を与え,シンテニー領域の探索および解釈を推進させる。

シソーラス用語： *プロテオーム ,  *配列相同性 ,  *ヌクレオチド配列 ,  *クラスタ ,  *可視化 ,  *ゲノム ,  遺伝学 ,  エキソン ,  頻度 ,  コドン ,  利用 ,  アミノ酸配列
準シソーラス用語： *シンテニー ,  ゲノミクス ,  コドン利用性

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 統計 ,  シンテニー ,  クラスタ ,  発見 ,  可視化