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J-GLOBAL ID：201502214984712910   整理番号：15A1303355

次世代シーケンサーデータの解析手法 第5回 アセンブル,マッピング,そしてQC

Methods for analyzing next-generation sequencing data V. assembly, mapping, and quality control

著者 (3件)： SUN Jianqiang (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  清水謙多郎 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  門田幸二 (東大 大学院農学生命科学研究科)
資料名： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
巻： 26  号： 3  ページ： 193-201  発行年： 2015年11月06日 
JST資料番号： L3534A  ISSN： 1343-327X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 次世代シーケンサー(以下,NGS)データの解析は,大まかに,...

シソーラス用語： *自動分析計 ,...
準シソーラス用語： ゲノム解析

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分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C)

引用文献 (40件)：

• 1) 門田幸二(2015)平成26年度 バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム(次世代シークエン サ)速習コース 実施報告書,http://biosciencedbc.jp/gadget/human/h26_ngs_report.pdf
• 2) 門田幸二(2014)シリーズ Useful R 第 7 巻 トランスクリプトーム解析,金明哲 編,共立出版,東京.
• 3) 孫建強,湯敏,清水謙多郎,門田幸二(2015)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 4 回クオリティコントロールとプログラムのインストール.日本乳酸菌学会誌 26:124-132.
• 4) Field D, Tiwari B, Booth T, Houten S, Swan D, et al. (2006) Open software for biologists: from famine to feast. Nat Biotechnol 24: 801-803.
• 5) Lo CC, Chain PS. (2014) Rapid evaluation and quality control of next generation sequencing data with FaQCs. BMC Bioinformatics 15: 366.

タイトルに関連する用語 (4件)： 次世代シーケンサー ,  解析手法 ,  マッピング ,  QC