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J-GLOBAL ID：201502215349575316   整理番号：15A0704956

組織特異性:ヒト組織特異的なネットワークにより多細胞性の機能と疾患を理解する

Understanding multicellular function and disease with human tissue-specific networks

著者 (18件)： GREENE Casey S (Geisel School of Medicine at Dartmouth, New Hampshire, USA) ,  ZELAYA Rene A (Geisel School of Medicine at Dartmouth, New Hampshire, USA) ,  GREENE Casey S (Dartmouth-Hitchcock Norris Cotton Cancer Center, New Hampshire, USA) ,  GREENE Casey S (Dartmouth Coll., New Hampshire, USA) ,  KRISHNAN Arjun (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  DOLINSKI Kara (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  TROYANSKAYA Olga G (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  WONG Aaron K (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  RICCIOTTI Emanuela (Univ. Pennsylvania, Pennsylvania, USA) ,  FITZGERALD Garret A (Univ. Pennsylvania, Pennsylvania, USA) ,  GROSSER Tilo (Univ. Pennsylvania, Pennsylvania, USA) ,  HIMMELSTEIN Daniel S (Univ. California, San Francisco, California, USA) ,  ZHANG Ran (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  HARTMANN Boris M (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, USA) ,  ZASLAVSKY Elena (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, USA) ,  SEALFON Stuart C (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, USA) ,  CHASMAN Daniel I (Brigham and Women’s Hospital and Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  TROYANSKAYA Olga G (Simons Foundation, New York, USA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 47  号： 6  ページ： 569-576  発行年： 2015年06月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 組織や細胞種を識別する仕組みは,ヒトの生理や疾患に深く関わっている。複雑な組織や個々の細胞の系譜に関する遺伝的な基盤を理解することは,診断法や治療法の向上にとって極めて重要である。我々は144のヒト組織と細胞種に関するゲノムワイドな機能相互作用ネットワークを作成した。このネットワークは,データ駆動型のベイズ法を用いて,さまざまな組織や疾患の状態に関する数千の実験結果を統合することにより生み出された。この組織特異的ネットワークを用いることにより,経路を乱す刺激に対する系統特異的な反応の予測,組織横断的な遺伝子の機能上の役割の違いの同定,疾患間の関係性を明らかにすることができる。今回我々は,NetWASについて紹介する。これは,疾患と遺伝子の関連をGWAS単独よりも正確に同定すべく,名目上有意なゲノムワイド関連研究(GWAS)のP値や組織特異的なネットワークを用いて,遺伝子どうしを結び付けるものである。我々のウェブサーバーGIANTは,複数の遺伝子の問い合わせ(クエリ),ネットワークの可視化,NetWASをはじめとする解析ツール,ダウンロード可能なネットワークといったヒト組織ネットワークへのインターフェースを提供している。GIANTは,100以上のヒト組織や細胞種を対象に,特化した細胞の機能を生み出す遺伝子の相互作用について,その全体像をシステマティックに探索することを可能にしている。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： ヒト ,  生体組織 ,  *ネットワーク ,  *ゲノムワイド関連解析 ,  Bayes推定 ,  生体内分布 ,  病気 ,  計算機システム
準シソーラス用語： *NetWAS ,  ウェブサーバ ,  *遺伝子ネットワーク ,  遺伝子相互作用

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 組織特異性 ,  ヒト ,  組織 ,  多細胞性 ,  疾患 ,  理解