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J-GLOBAL ID：201502215994183199   整理番号：15A0885449

改良型進化アルゴリズムを用いる大規模データセットからのインフォーマティブな一塩基多型の選択

Selection Informative Single Nucleotide Polymorphisms Using Improved Evolutionary Algorithm from Large Scale Dataset

著者 (3件)： LIU Min (Hunan Vocational Coll. Sci. and Technol., Hunan, CHN) ,  TANG Jun (Hunan Vocational Coll. Sci. and Technol., Hunan, CHN) ,  YE Hui (Changsha Univ., Hunan, CHN)
資料名： Journal of Computational and Theoretical Nanoscience  (Journal of Computational and Theoretical Nanoscience)
巻： 12  号： 8  ページ： 1821-1826  発行年： 2015年08月 
JST資料番号： W2377A  ISSN： 1546-1955  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 大規模な一塩基多型(SNP)データセットから連鎖不平衡に基づいてインフォーマティブなSNPの候補を選択するための改良型進化アルゴリズム(IEA)を開発した。最初に,情報理論に基づいて新しいフィットネス関数をデザインした。また,SNP間の冗長性を測定するために,新しい多重遺伝子座連鎖不平衡測定法を開発した。次に,候補のインフォーマティブなSNPを絞り込むために前進選択スキームをデザインし,予測性能に従ってインフォーマティブなSNPを得た。IEAの性能を調べるために,種々の測定値をもつ小さなデータセットおよび大きなデータセットに適用した。その結果,IEAは小さなデータセットに対して良好な性能を示すとともに,大きなデータセットも効果的に取り扱うことができることが分かった。

シソーラス用語： 集合 ,  *一塩基多型 ,  *ゲノムワイド関連解析 ,  *サポートベクトルマシン ,  性能 ,  遺伝学実験技術 ,  *情報理論 ,  冗長性 ,  遺伝的連鎖
準シソーラス用語： 連鎖 ,  データセット ,  *進化アルゴリズム ,  *選択法 ,  予測性能 ,  連鎖不平衡

分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 進化アルゴリズム ,  大規模データセット ,  一塩基多型