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J-GLOBAL ID：201502216049629616   整理番号：15A1258950

MetaQuery:ヒト腸ミクロビオームにおける特異的遺伝子の迅速なアノテーションと定量解析のためのWebサーバー

MetaQuery: a web server for rapid annotation and quantitative analysis of specific genes in the human gut microbiome

著者 (3件)： NAYFACH Stephen (Univ. California San Francisco, CA, USA) ,  FISCHBACH Michael A. (Univ. California San Francisco, CA, USA) ,  POLLARD Katherine S. (Univ. California San Francisco, CA, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 20  ページ： 3368-3370  発行年： 2015年10月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： MetaQueryは,ヒト腸ミクロビオームにおいて特異的な遺伝子を迅速かつ定量的に解析するためのWebアプリケーションである。1以上のクエリー遺伝子を入力すると,1267個体由来の糞便メタゲノムにおけるこれらの遺伝子の推定存在量が示される。さらに,遺伝子共変異,分類群,臨床的変数(例えば炎症性腸疾患,糖尿病),平均ゲノムサイズなどの遺伝子多様性に関わる特徴を同定するための統計解析も行うことができる。

シソーラス用語： *応用プログラム ,  *ゲノム ,  *腸内微生物 ,  ヒト ,  情報科学 ,  生物学 ,  生物多様性 ,  糞便 ,  豊度 ,  迅速分析 ,  定量分析 ,  遺伝学実験技術
準シソーラス用語： *MetaQuery ,  Webアプリケーション ,  シーケンス解析 ,  バイオインフォマティクス ,  *ミクロビオーム ,  *メタゲノム ,  遺伝子解析 ,  遺伝子多様性

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (7件)： ヒト ,  腸 ,  ミクロビオーム ,  遺伝子 ,  アノテーション ,  定量解析 ,  Webサーバー