文献

J-GLOBAL ID：201502216076658628   整理番号：15A1184383

グルコース輸送体の同定のためのAspergillus niger膜関連プロテオーム解析

Aspergillus niger membrane-associated proteome analysis for the identification of glucose transporters

著者 (6件)： SLOOTHAAK J. (Wageningen Univ., Wageningen, NLD) ,  ODONI D. I. (Wageningen Univ., Wageningen, NLD) ,  DE GRAAFF L. H. (Wageningen Univ., Wageningen, NLD) ,  DOS SANTOS V. A. P. Martins (Wageningen Univ., Wageningen, NLD) ,  SCHAAP P. J. (Wageningen Univ., Wageningen, NLD) ,  TAMAYO-RAMOS J. A. (Wageningen Univ., Wageningen, NLD)
資料名： Biotechnology for Biofuels (Web)  (Biotechnology for Biofuels (Web))
巻： 8  号： Sept  ページ： 8:150 (WEB ONLY)  発行年： 2015年09月 
JST資料番号： U7022A  ISSN： 1754-6834  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,機能的に実証された同定およびセグメンテーションにおいて良好な性能を示す隠れMarkovモデル(HMM)を構築した。モデル(HMM_glut)を用いて,低pHでの高および低グルコース濃度へのAspergillus niger膜関連プロテオーム応答を解析した。そのHMM_glutスコアとA.niger細胞膜プロテオームで見出された蛋白質の豊度パターンを組み合わせることにより,HstGおよびHstHとして示された2つの新しい推定上の高親和性グルコース輸送体を同定した。MstGおよびMstHは機能的に検証され,S.cerevisiaeグルコース輸送ヌル突然変異体における異種発現により生化学的に特性化された。これらは,それぞれ高親和性グルコース輸送体(Km=0.5±0.04mM)および超高親和性グルコース輸送体(Km=0.06±0.005mM)であることが示された。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *グルコース輸送体 ,  *膜 ,  解析 ,  *プロテオーム ,  隠れMarkovモデル ,  細胞膜 ,  タンパク質 ,  豊度 ,  Saccharomyces cerevisiae ,  突然変異体 ,  遺伝子発現 ,  *Aspergillus niger
準シソーラス用語： *黒色麹菌 ,  *プロテオーム解析 ,  S. cerevisiae ,  異種発現

分類 (3件)： 細胞膜の輸送  (EF04020R) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (4件)： グルコース輸送体 ,  同定 ,  Aspergillus ,  プロテオーム解析