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J-GLOBAL ID：201502217464966470   整理番号：15A1244311

大域的釣り合いあるは詳細釣り合い条件に基づくシミュレーテッドテンパリング:Suwa-Todo,熱浴,およびメトロポリスアルゴリズム

Simulated tempering based on global balance or detailed balance conditions: Suwa-Todo, heat bath, and Metropolis algorithms

著者 (2件)： MORI Yoshiharu (Dep. of Theoretical and Computational Molecular Sci., Inst. for Molecular Sci., Okazaki, Aichi, 444-8585, JPN) ,  OKUMURA Hisashi
資料名： Journal of Computational Chemistry  (Journal of Computational Chemistry)
巻： 36  号： 31  ページ： 2344-2349  発行年： 2015年12月05日 
JST資料番号： C0111B  ISSN： 0192-8651  CODEN： JCCHDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分子シミュレーションのサンプリングを強化するためシミュレーテッドテンパリング(ST)は有用な方法である。STを用いたとき,遷移確率を計算するのに詳細釣り合い条件を満足するメトロポリスアルゴリズムが適用される。最近,詳細釣り合い条件の代わりに大域的釣り合い条件を満足する代替法がSuwaとTodoにより提案された。本研究においては,Suwa-TodoアルゴリズムによるST法を提案した。遷移確率を計算するのに,STによる分子動力学シミュレーションを三つのアルゴリズム(メトロポリス,熱浴,およびSuwa-Todoアルゴリズム)により行った。三つのアルゴリズムの中で,Suwa-Todoアルゴリズムが最高のアクセプタンス比と最短の自己相関時間をもたらした。これらのことは,Suwa-TodoアルゴリズムによるSTシミュレーションでのサンプリングが最も効率的なことを示唆する。加えて,Suwa-Todoアルゴリズムのアクセプタンス比がメトロポリスアルゴリズムのそれよりも高いが故に,Suwa-Todoアルゴリズムに対して温度状態の個数をメトロポリスアルゴリズムと比較したとき25%縮小できる。Copyright 2016 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *釣合 ,  *シミュレーション ,  *標本抽出 ,  *分子動力学 ,  遷移確率 ,  モンテカルロ法 ,  計算機シミュレーション ,  アクセプタンス ,  温度条件 ,  自己相関 ,  時間 ,  熱浴
準シソーラス用語： 詳細釣合 ,  *分子シミュレーション ,  メトロポリス法 ,  分子動力学シミュレーション ,  温度状態 ,  相関時間

分類 (3件)： 物理化学一般  (CB01010X) ,  数値計算  (JE02000J) ,  分子の電子構造  (BH05010Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 釣り合い ,  詳細釣り合い ,  熱浴 ,  メトロポリス ,  アルゴリズム