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J-GLOBAL ID：201502218030193169   整理番号：15A0680014

胚幹細胞に適用した単細胞トランスクリプトミクスの液滴バーコーディング

Droplet Barcoding for Single-Cell Transcriptomics Applied to Embryonic Stem Cells

著者 (12件)： KLEIN Allon M. (Dep. of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  MAZUTIS Linas (School of Engineering and Applied Sciences (SEAS), Harvard Univ., Cambridge, MA 02138, USA) ,  MAZUTIS Linas (Vilnius Univ. Inst. of Biotechnology, Vilnius LT-02241, LTU) ,  AKARTUNA Ilke (School of Engineering and Applied Sciences (SEAS), Harvard Univ., Cambridge, MA 02138, USA) ,  TALLAPRAGADA Naren (Dep. of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  VERES Adrian (Dep. of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  VERES Adrian (Dep. of Stem Cell and Regenerative Biology, Harvard Univ., Cambridge, MA 02138, USA) ,  VERES Adrian (Harvard Stem Cell Inst., Harvard Univ., Cambridge, MA 02138, USA) ,  LI Victor (Dep. of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  PESHKIN Leonid (Dep. of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  WEITZ David A. (School of Engineering and Applied Sciences (SEAS), Harvard Univ., Cambridge, MA 02138, USA) ,  KIRSCHNER Marc W. (Dep. of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 161  号： 5  ページ： 1187-1201  発行年： 2015年05月21日 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 単細胞レベルで遺伝子発現をマッピングすることは,生物学者の長年の夢であった。このようなデータにより,不均一細胞亜集団を追跡し,また遺伝子と経路の制御的関連性を推測可能になる。近年,RNA配列決定は単細胞解像度を達成した。限られているのは定量的な詳細配列決定のために大多数の個別細胞を定期的に分離して処理する効果的な方法である。著者らは,次世代配列決定による継続的な解析のため,数千の個別細胞に由来するRNAをバーコーディングするためのハイスループット液滴マイクロアプローチを開発した。この方法は驚くほどの低ノイズ特性を示し,また他の配列決定ベースの解析へすでに応用可能である。著者らは,マウス胚幹細胞を解析し,これは詳細な集団構造ならびに白血病阻害因子(LIF)除去後の不均一な分化開始を明らかにする。これらハイスループット単細胞データの再現性は,細胞集団を脱構築し,遺伝子発現関連性を推測可能とする。Copyright 2015 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： マウス ,  *ES細胞 ,  バーコード ,  遺伝子発現 ,  遺伝的調節 ,  マイクロ流体デバイス ,  *フローインジェクション分析 ,  *遺伝学実験技術 ,  *解析 ,  トランスクリプトーム ,  細胞分化 ,  生化学的分析 ,  ポピュレーションダイナミックス ,  細胞生理
準シソーラス用語： DNAバーコーディング ,  *トランスクリプトーム解析 ,  トランスクリプトミクス ,  *マイクロ流体分析技術 ,  マウスES細胞 ,  遺伝子発現プロファイリング ,  幹細胞分化 ,  細胞動態 ,  単一細胞解析

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (5件)： 胚幹細胞 ,  単細胞 ,  トランスクリプトミクス ,  液滴 ,  バーコーディング