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J-GLOBAL ID：201502218586366151   整理番号：15A0367565

単一細胞の遺伝子発現の測定による初期血液発生の調節ネットワークの解読

Decoding the regulatory network of early blood development from single-cell gene expression measurements

著者 (20件)： MOIGNARD Victoria (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  WOODHOUSE Steven (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  TANAKA Yosuke (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  WILKINSON Adam C (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  JAWAID Wajid (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  DIAMANTI Evangelia (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  GOETTGENS Berthold (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  HAGHVERDI Laleh (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  BUETTNER Florian (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  THEIS Fabian J (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  HAGHVERDI Laleh (Technische Univ. Muenchen, Garching, DEU) ,  THEIS Fabian J (Technische Univ. Muenchen, Garching, DEU) ,  LILLY Andrew J (Univ. Manchester, Manchester, GBR) ,  KOUSKOFF Valerie (Univ. Manchester, Manchester, GBR) ,  TANAKA Yosuke (RIKEN, Kobe, JPN) ,  NISHIKAWA Shin-Ichi (RIKEN, Kobe, JPN) ,  MACAULAY Iain C (Wellcome Trust Sanger Inst., Cambridge, GBR) ,  PITERMAN Nir (Univ. Leicester, Leicester, GBR) ,  FISHER Jasmin (Microsoft Res. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  FISHER Jasmin (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 33  号： 3  ページ： 269-276  発行年： 2015年03月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 器官発生を制御する分子経路の再構築は,胚の前駆細胞を分析する方法が存在しないために困難であった。本論文では,多数の単一細胞を対象とする遺伝子発現プロファイル解析と次元圧縮のための拡散マップに基づくデータ解析および状態遷移グラフからのネットワーク統合とを組み合わせた方法でこの問題に取り組む。この方法をマウス胚の造血発生に適用し,E7.0~E8.5の4時点で集めた血液形成能を有する細胞3934個の単一細胞遺伝子発現解析により,中胚葉から血液への発生過程をマップした。次に,個々の細胞状態間の遷移を入力に用いて単一細胞ネットワーク統合ツールキットを開発し,コンピューターで実行可能な血液発生の転写調節ネットワークモデルを構築した。SoxおよびHox因子の役割に関する複数のモデル予測を実験的に検証した。今回の結果は,発生中の器官の単一細胞解析をコンピューター解析法と組み合わせることで器官形成を支える転写プログラムが明らかにされることを示している。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： 生化学的分析 ,  遺伝子発現 ,  ネットワーク ,  マウス ,  形態形成 ,  細胞分化 ,  *血液成分 ,  *細胞 ,  予測モデル ,  解析 ,  DNA結合タンパク質 ,  HMGタンパク質 ,  転写因子 ,  ホメオボックス遺伝子 ,  発生生理 ,  *胚発生
準シソーラス用語： 単一細胞解析 ,  遺伝子発現プロファイル ,  転写調節ネットワーク ,  器官形成 ,  *血液細胞 ,  ネットワーク解析 ,  Sox蛋白質 ,  Hox遺伝子 ,  初期発生

分類 (4件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生体系モデル一般  (EL02010K) ,  発生と分化  (EJ16020W) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (6件)： 単一細胞 ,  遺伝子発現 ,  初期 ,  血液 ,  調節ネットワーク ,  解読