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J-GLOBAL ID：201502218726674669   整理番号：15A0886482

Cardinal 質量分析ベース画像化実験の統計解析のためのRパッケージ

Cardinal: an R package for statistical analysis of mass spectrometry-based imaging experiments

著者 (8件)： BEMIS Kyle D. (Purdue Univ., IN, USA) ,  HARRY April (Purdue Univ., IN, USA) ,  EBERLIN Livia S. (Purdue Univ., IN, USA) ,  FERREIRA Christina (Purdue Univ., IN, USA) ,  VAN DE VEN Stephanie M. (Stanford Univ. School of Medicine, CA, USA) ,  MALLICK Parag (Stanford Univ. School of Medicine, CA, USA) ,  STOLOWITZ Mark (Stanford Univ. School of Medicine, CA, USA) ,  VITEK Olga (Northeastern Univ., MA, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 14  ページ： 2418-2420  発行年： 2015年07月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生体試料の質量分析ベースイメージング(MSI)実験の統計解析のためのRパッケージCardinalについて示した。Cardinalにより,マトリックス支援レーザー脱離イオン化(MALDI)および脱離エレクトロスプレーイオン化に基づく質量分析法ベース画像化と,多様な組織および複雑なデザインの実験が支援された。組織を均一な化学組成の領域に分割する画像セグメンテーションにより,セグメントの数および情報的なイオンのサブセットが選択され,関連する不確かさが特徴付けられた。組織上の位置を前もって定義されたクラスにアサインする画像分類により,情報的なイオンのサブセットが選択され,交差検証により得られた分類エラーが推定された。統計的方法は,混合モデリングおよび正則化に基づいた。Cardinalはウェブサイトから入手可能である。

シソーラス用語： *ソフトウェア ,  *質量分析 ,  *統計解析 ,  *生体試料 ,  MALDI-MS ,  エレクトロスプレイイオン化質量分析 ,  セグメンテーション ,  画像処理 ,  情報科学 ,  生物学 ,  プログラムパッケージ
準シソーラス用語： *Cardinal ,  バイオイメージング ,  バイオインフォマティクス ,  マトリックス支援レーザ脱離イオン化質量分析 ,  画像セグメンテーション ,  *画像化

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： 質量分析 ,  画像化 ,  実験 ,  統計解析 ,  Rパッケージ