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J-GLOBAL ID：201502219103350060   整理番号：15A0926054

カイコ,Bombyx moriからのBacillus bombysepticusのゲノム配列,構造解析と機能的注釈【Powered by NICT】

Genome Sequencing,Structural Analysis and Functional Annotations of Bacillus bombysepticus from the Silkworm,Bombyx mori

著者 (6件)： Cheng Tingcai (State Key Lab. of Silkworm Genome Biology,Southwest Univ., Chongqing) ,  Lin Ping (State Key Lab. of Silkworm Genome Biology,Southwest Univ., Chongqing) ,  Jin Shengkai (State Key Lab. of Silkworm Genome Biology,Southwest Univ., Chongqing) ,  Fu Bohua (State Key Lab. of Silkworm Genome Biology,Southwest Univ., Chongqing) ,  Long Renwen (State Key Lab. of Silkworm Genome Biology,Southwest Univ., Chongqing) ,  Xia Qingyou (State Key Lab. of Silkworm Genome Biology,Southwest Univ., Chongqing)
資料名： Canye Kexue  (Canye Kexue)
巻： 40  号： 6  ページ： 1036-1043  発行年： 2014年 
JST資料番号： C2131A  ISSN： 0257-4799  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： Bacillus bombyseptieusはカイコにおける黒胸部敗血症(Bombyx mori)を引き起こす一般的な細菌性病原体の一つである。本論文では,配列特徴とB.bombyseptieusゲノムの構造的および機能的注釈は,B.bombyseptieusゲノム配列の配列決定と集合に基づいて焦点を当てた。配列決定からの生データの2 1Gbを発生させ,ゲノムに360倍以上の被覆率で,B.bombyseptieusの5 87Mbゲノムに,二レプリコン,核ゲノム(5 295. 783 kb)の一つであり,プラスミドゲノム(577. 809 kb)の一つを含むを構築した。反復配列の割合は,核ゲノム,136非コードRNAと5 298予測蛋白質コード遺伝子を含む1。179 2%を占めている。KEGGとCOGデータベースを用いたB.bombyseptieusゲノムの機能的アノテーションは,大部分の遺伝子は,輸送,アミノ酸代謝と炭水化物代謝に関与していることを示した。ゲノムシンテニー分析はB.bombyseptieusはBacillus属の細菌に密接に関係することを示した。これらの結果は,B.bombyseptieusの重要な病原性因子を見出し,宿主との感染機構と相互作用の理解を促進するのに役立つであろう。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *カイコ ,  反復配列 ,  *ゲノム ,  宿主 ,  予測 ,  *桿菌属 ,  *配列 ,  *アノテーション ,  感染 ,  タンパク質 ,  *カイコガ ,  病原体 ,  *構造解析
準シソーラス用語： *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 養蚕一般  (FD04010B) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： カイコ ,  Bacillus ,  ゲノム配列 ,  構造解析 ,  注釈