文献

J-GLOBAL ID：201502219752274551   整理番号：15A0762729

MDAT:多重ドメイン配置のアライニング

MDAT- Aligning multiple domain arrangements

著者 (3件)： KEMENA Carsten (Univ. Muenster, Muenster, DEU) ,  BITARD-FEILDEL Tristan (Univ. Muenster, Muenster, DEU) ,  BORNBERG-BAUER Erich (Univ. Muenster, Muenster, DEU)
資料名： BMC Bioinformatics (Web)  (BMC Bioinformatics (Web))
巻： 16  号： Jan  ページ： 16:19 (WEB ONLY)  発行年： 2015年01月 
JST資料番号： U7025A  ISSN： 1471-2105  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:蛋白質はドメインから構成され,それらの蛋白質セグメントは残りの蛋白質から独立して折畳まれ,特異的な機能を持つ。進化においてドメイン配置は変化し,ドメインの獲得,消失あるいはそれら順序の再配置が生じる。これらの変化の解析を容易にするために,多重ドメインアライメントの利用を提案した。結果:多重ドメイン配置をアライメントするためにMDATと命名したプログラムを開発した。MDATはドメイン配置の対アライメントを行う初期プログラムを拡張する。MDATはドメイン対を採点するためにドメイン類似度マトリックスを用い,コンシステンシー支持プログレッシブアラインメント法を使用してドメイン配置をアライメントする。結論:MDATは蛋白質ファミリー内/間におけるドメイン配置変化の解析に有用であり,蛋白質とそれらのドメインの進化に有益な洞察を提供する。MDATはC++でコードされ,ソースコードはhttp://www.bornberglab.org/pages/mdatから無料でダウンロード可能である。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *アラインメント ,  分子構造 ,  予測技法 ,  セグメント ,  *構成 ,  *配置 ,  *配列 ,  度 ,  コンシステンシー【計算機】 ,  分子進化 ,  構造
準シソーラス用語： *タンパク質ドメイン ,  ドメイン構造 ,  *再配置 ,  蛋白質構造 ,  蛋白質構造予測 ,  蛋白質進化 ,  *蛋白質折畳み ,  類似度

分類 (4件)： 理論生物学一般  (EA02010D) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (2件)： 多重 ,  ドメイン