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J-GLOBAL ID：201502226819617063   整理番号：15A0680015

ナノリットル液滴を用いる個別細胞の高度に平行なゲノムワイド発現プロファイリング

Highly Parallel Genome-wide Expression Profiling of Individual Cells Using Nanoliter Droplets

著者 (33件)： MACOSKO Evan Z. (Dep. of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  MACOSKO Evan Z. (Stanley Center for Psychiatric Res., Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  MACOSKO Evan Z. (Program in Medical and Population Genetics, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  BASU Anindita (Klarman Cell Observatory, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  BASU Anindita (School of Engineering and Applied Sciences, Harvard Univ., Cambridge, MA 02138, USA) ,  SATIJA Rahul (Klarman Cell Observatory, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  SATIJA Rahul (New York Genome Center, New York, NY 10013, USA) ,  SATIJA Rahul (Dep. of Biology, New York Univ., New York, NY 10003, USA) ,  NEMESH James (Dep. of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  NEMESH James (Stanley Center for Psychiatric Res., Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  NEMESH James (Program in Medical and Population Genetics, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  SHEKHAR Karthik (Klarman Cell Observatory, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  GOLDMAN Melissa (Dep. of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  GOLDMAN Melissa (Stanley Center for Psychiatric Res., Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  TIROSH Itay (Klarman Cell Observatory, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  BIALAS Allison R. (The Program in Cellular and Molecular Medicine, Children’s Hospital Boston, Boston, MA 02115, USA) ,  KAMITAKI Nolan (Dep. of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  KAMITAKI Nolan (Stanley Center for Psychiatric Res., Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  KAMITAKI Nolan (Program in Medical and Population Genetics, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  MARTERSTECK Emily M. (Dep. of Molecular and Cellular Biology and Center for Brain Sci., Harvard Univ., Cambridge, MA 02138, USA) ,  TROMBETTA John J. (Klarman Cell Observatory, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  WEITZ David A. (School of Engineering and Applied Sciences, Harvard Univ., Cambridge, MA 02138, USA) ,  WEITZ David A. (Dep. of Physics, Harvard Univ., Cambridge, MA 02138, USA) ,  SANES Joshua R. (Dep. of Molecular and Cellular Biology and Center for Brain Sci., Harvard Univ., Cambridge, MA 02138, USA) ,  SHALEK Alex K. (Klarman Cell Observatory, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  SHALEK Alex K. (Ragon Inst. of MGH, MIT, and Harvard, Cambridge, MA 02139, USA) ,  SHALEK Alex K. (Inst. for Medical Engineering and Sci. and Dep. of Chemistry, MIT, Cambridge, MA 02139, USA) ,  REGEV Aviv (Klarman Cell Observatory, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  REGEV Aviv (Dep. of Biology, MIT, Cambridge, MA 02139, USA) ,  REGEV Aviv (Howard Hughes Medical Inst., Chevy Chase, MD 20815, USA) ,  MCCARROLL Steven A. (Dep. of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  MCCARROLL Steven A. (Stanley Center for Psychiatric Res., Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  MCCARROLL Steven A. (Program in Medical and Population Genetics, Broad Inst. of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 161  号： 5  ページ： 1202-1214  発行年： 2015年05月21日 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生物学的構造および機能の基本単位である細胞は,型と状態が広範に変化する。単細胞ゲノミクスは細胞特性と機能を解析可能であるが,簡便性と規模の制限がその広範囲への応用を妨げている。本稿で著者らは,ナノリットルサイズの水滴に分離し,各細胞のRNAsにより異なるバーコードを関連付け,さらにそれらを全て一括して配列決定することによって数千の個別細胞を迅速にプロファイリングするための戦略であるDrop-seqを記述する。Drop-seqは,転写産物の細胞の起源を記憶しつつ,数千の個別細胞に由来するmRNA転写産物を解析する。著者らは,44808のマウス網膜細胞に由来するトランスクリプトームを解析して39の転写的に異なる細胞集団を同定した。これは,既知の網膜細胞クラスと新規の細胞サブタイプ候補に対する遺伝子発現の分子アトラスを創出する。Drop-seqは,単細胞解像度での定常的な転写プロファイリングを可能にすることにより,生物学的な発見を促進する。Copyright 2015 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： ヒト ,  マウス ,  培養細胞 ,  バーコード ,  *遺伝子発現 ,  遺伝的調節 ,  マイクロ流体デバイス ,  *フローインジェクション分析 ,  *遺伝学実験技術 ,  *解析 ,  トランスクリプトーム ,  生化学的分析 ,  ポピュレーションダイナミックス ,  細胞生理 ,  ヌクレオチド配列 ,  細胞周期 ,  形質発現
準シソーラス用語： DNAバーコーディング ,  *トランスクリプトーム解析 ,  トランスクリプトミクス ,  *マイクロ流体分析技術 ,  遺伝子配列決定 ,  *遺伝子発現プロファイリング ,  単一細胞解析 ,  培養細胞株 ,  分子配列注釈

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (6件)： リットル ,  液滴 ,  細胞 ,  ゲノム ,  発現 ,  プロファイリング