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J-GLOBAL ID：201502229166116470   整理番号：15A0761062

ヒトP2Y₁₄受容体の分子モデリング: 選択的アゴニストリガンドの構造ベース設計のための鋳型

Molecular modeling of the human P2Y₁₄ receptor: A template for structure-based design of selective agonist ligands

著者 (4件)： TRUJILLO Kevin (Molecular Recognition Section, Lab. of Bioorganic Chemistry, National Inst. of Diabetes and Digestive and Kidney ...) ,  PAOLETTA Silvia (Molecular Recognition Section, Lab. of Bioorganic Chemistry, National Inst. of Diabetes and Digestive and Kidney ...) ,  KISELEV Evgeny (Molecular Recognition Section, Lab. of Bioorganic Chemistry, National Inst. of Diabetes and Digestive and Kidney ...) ,  JACOBSON Kenneth A. (Molecular Recognition Section, Lab. of Bioorganic Chemistry, National Inst. of Diabetes and Digestive and Kidney ...)
資料名： Bioorganic & Medicinal Chemistry  (Bioorganic & Medicinal Chemistry)
巻： 23  号： 14  ページ： 4056-4064  発行年： 2015年07月15日 
JST資料番号： W0556A  ISSN： 0968-0896  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： P2Y₁₄受容体(P2Y₁₄R)はウラシルヌクレオチド,UDP及びUDP-グルコースにより活性化されるG_i蛋白質共役受容体である。P2Y₁₄R構造は,X線結晶学によりまだ解明されていないが,P2Y₁₂Rの最近のアゴニスト結合の結晶構造は,選択的高親和性リガンドの合理的構造ベース設計のホモロジーモデリングとして潜在的に適切な鋳型を提示する。本研究では,P2Y₁₄Rホモロジーモデルにリガンドドッキングと分子動力学改良を適用し,既報合成ヌクレオチド類似体の構造活性相関を定性的に解明し構造ベース設計の鋳型としてP2Y₁₄Rのホモロジーモデリングの品質を調べた。P2Y₁₄Rモデルは機能的保存残基を含むP2Y₁₂様受容体中の3つのヌクレオチドの保存的結合モード仮説を支持する。本稿では,P2Y₁₂様受容体のR253^6.55,K277^7.35,Y256^6.58,Q260^6.62とリン酸基との相互作用,核酸塩基(anti立体配座)π-πスタッキングとY102^3.33との相互作用とF191^5.42の役割を予測する。UDP-グルコースのグルコース部分はP2Y₁₄Rホモロジーモデルで二次サブポケットにドッキングした。したがって,P2Y₁₄Rホモロジーモデリングは,P2Y₁₄R研究用の薬理学的ツールとしての高親和性選択的アゴニスト設計を容易にする相互作用の詳細な予測を可能にし得る。Copyright 2015 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *プリン受容体 ,  分子モデル ,  分子構造 ,  ドッキング ,  計算機シミュレーション ,  構造最適化 ,  ドラッグデザイン ,  *UDP糖 ,  *ヌクレオチド類似体 ,  結合部位 ,  配位子効果 ,  アミノ酸配列 ,  CAD【計算機】 ,  分子標的治療薬 ,  ヌクレオチド ,  ピリミジンヌクレオチド ,  リボヌクレオチド
準シソーラス用語： *P2Y14受容体 ,  コンピュータ支援ドラッグデザイン ,  ホモロジーモデル ,  分子ドッキングシミュレーション ,  分子動力学シミュレーション

分類 (3件)： ヌクレオシド,ヌクレオチド  (CF10060K) ,  細胞膜の受容体  (EF04030C) ,  薬物の相互作用  (GV01070X)

物質索引 (1件)： UDPグルコース

タイトルに関連する用語 (5件)： ヒト ,  受容体 ,  分子モデリング ,  設計 ,  鋳型