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J-GLOBAL ID：201502237520774261   整理番号：15A0428964

異なる結合モードを持つキナーゼ阻害剤により形成される三次元活性クリフの網羅的解析および構造アナログのクリフマッピング

Comprehensive Analysis of Three-Dimensional Activity Cliffs Formed by Kinase Inhibitors with Different Binding Modes and Cliff Mapping of Structural Analogues

著者 (3件)： FURTMANN Norbert (Rheinische Friedrich-Wilhelms-Univ., Bonn, DEU) ,  HU Ye (Rheinische Friedrich-Wilhelms-Univ., Bonn, DEU) ,  BAJORATH Juergen (Rheinische Friedrich-Wilhelms-Univ., Bonn, DEU)
資料名： Journal of Medicinal Chemistry  (Journal of Medicinal Chemistry)
巻： 58  号： 1  ページ： 252-264  発行年： 2015年01月08日 
JST資料番号： D0102A  ISSN： 0022-2623  CODEN： JMCMAR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： キナーゼ-阻害剤複合体のX線結晶構造および関連した活性データに基づいて,キナーゼ阻害剤によって形成される全ての三次元(3D)クリフを特定および分類した。1322種類のX線結晶構造データの結合モードの比較および構造に関する相同性解析から,合計105の3Dクリフを特定した。これら3Dクリフは以下の6つのカテゴリーに分類できた;1)水素結合および/あるいはイオン相互作用,2)脂溶性および芳香族基による相互作用,3)水媒介性水素結合,4)立体異性体,5)複数の相互作用,および6)明確な相互作用を持たない。3Dクリフ阻害剤の200以上の構造アナログに関するマッピングおよび構造-活性相関研究も行い,活性に影響する幾つかの構造的要素を提示した。これらの知見はキナーゼ阻害剤の構造ベースの設計に役立つ。

シソーラス用語： *酵素阻害剤 ,  モード解析 ,  構造 ,  X線構造解析 ,  相同性 ,  タンパク質 ,  立体配座 ,  水素結合 ,  立体異性体 ,  *構造活性相関 ,  分子設計 ,  *複合体 ,  *結晶構造 ,  データベース ,  毒性試験 ,  濃度 ,  *ドラッグデザイン
準シソーラス用語： IC50 ,  X線結晶構造解析 ,  *キナーゼ阻害剤 ,  結合モード解析 ,  *構造ベース薬剤設計 ,  *酵素阻害剤複合体 ,  三次元構造 ,  蛋白質データバンク ,  蛋白質構造的相同性

分類 (4件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  薬物の合成  (GV01030F) ,  薬物の構造活性相関  (GV01050B) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

タイトルに関連する用語 (5件)： 結合モード ,  キナーゼ阻害剤 ,  活性 ,  網羅的解析 ,  アナログ