文献

J-GLOBAL ID：201502242140304207   整理番号：15A0298312

LongTarget Hoogsteen塩基対解析を通じてlncRNA DNA結合モチーフおよび結合部位を予測するためのツール

LongTarget: a tool to predict lncRNA DNA-binding motifs and binding sites via Hoogsteen base-pairing analysis

著者 (4件)： HE Sha (Southern Medical Univ., Guangzhou, CHN) ,  ZHANG Hai (Southern Medical Univ., Guangzhou, CHN) ,  LIU Haihua (Southern Medical Univ., Guangzhou, CHN) ,  ZHU Hao (Southern Medical Univ., Guangzhou, CHN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 2  ページ： 178-186  発行年： 2015年01月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 長い非コードRNA(lncRNA) DNA結合モチーフおよび結合部位を予測するため計算法およびプログラム(LongTarget)について述べた。このプログラムを用いて既知の刷込クラスタを制御するものを含む多重アンチセンスlncRNAを解析し,実験観察およびエピジェネティクスマークと一致する結果を得た。多くのlncRNA DNA結合モチーフおよび結合部位を予測するため,この方法は実行可能であることを結果が示唆した。

シソーラス用語： 塩基対 ,  *RNA【核酸】 ,  結合 ,  *DNA【核酸】 ,  *結合部位 ,  計算 ,  *計算機プログラム ,  刷込 ,  クラスタ ,  アンチセンスRNA ,  遺伝学 ,  実験 ,  エピジェネティクス
準シソーラス用語： *DNA結合 ,  Hoogsteen塩基対 ,  計算法 ,  *非コードRNA

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  数値計算  (JE02000J)

タイトルに関連する用語 (8件)： Hoogsteen塩基対 ,  解析 ,  lncRNA ,  DNA結合 ,  モチーフ ,  結合部位 ,  予測 ,  ツール