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J-GLOBAL ID：201502244582823753   整理番号：15A0589985

MiSeq(Illumina)システムのディープメート-ペアシークエンシングにより確立した植物病原性真菌Rhizoctonia solani AG1-IB 7/3/14の改善ゲノム配列

Improved genome sequence of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB 7/3/14 as established by deep mate-pair sequencing on the MiSeq (Illumina) system

著者 (11件)： WIBBERG Daniel (Inst. for Genome Res. and Systems Biology, CeBiTec, Bielefeld Univ., D-33501 Bielefeld, DEU) ,  RUPP Oliver (Bioinformatics and Systems Biology, Giessen Univ., D-35392 Giessen, DEU) ,  JELONEK Lukas (Bioinformatics and Systems Biology, Giessen Univ., D-35392 Giessen, DEU) ,  KROEBER Magdalena (Inst. for Genome Res. and Systems Biology, CeBiTec, Bielefeld Univ., D-33501 Bielefeld, DEU) ,  VERWAAIJEN Bart (Inst. for Genome Res. and Systems Biology, CeBiTec, Bielefeld Univ., D-33501 Bielefeld, DEU) ,  BLOM Jochen (Bioinformatics and Systems Biology, Giessen Univ., D-35392 Giessen, DEU) ,  WINKLER Anika (Inst. for Genome Res. and Systems Biology, CeBiTec, Bielefeld Univ., D-33501 Bielefeld, DEU) ,  GOESMANN Alexander (Bioinformatics and Systems Biology, Giessen Univ., D-35392 Giessen, DEU) ,  GROSCH Rita (Leibniz-Institute of Vegetables and Ornamental Crops, D-14979 Grossbeeren, DEU) ,  PUEHLER Alfred (Inst. for Genome Res. and Systems Biology, CeBiTec, Bielefeld Univ., D-33501 Bielefeld, DEU) ,  SCHLUETER Andreas (Inst. for Genome Res. and Systems Biology, CeBiTec, Bielefeld Univ., D-33501 Bielefeld, DEU)
資料名： Journal of Biotechnology  (Journal of Biotechnology)
巻： 203  ページ： 19-21  発行年： 2015年06月10日 
JST資料番号： A0456C  ISSN： 0168-1656  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Basidiomycotaの植物病原性真菌Rhizoctonia solani AG1-IBは経済的に重要な各種作物に影響を与えまる。吻合群AG1-IBのR.solani分離菌7/3/14のデープリシクエンシングを,メイトペアモードを適用したIllumina MiSeqシステムにより行った。得られた配列リードの組み立てはスカフォードの量をかなり減少して,ゲノム配列を以前のシーケンシング法と比較して改善した。AG1-IB分離菌7/3/14のゲノム配列は病因における役割が予測されるゲノム特性を分析するための,そしてこの菌の病原性の影響に拮抗する方法を開発するためのアップグレード基盤を提供した。Copyright 2015 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *Rhizoctonia solani ,  *ヌクレオチド配列 ,  植物病原菌 ,  遺伝学実験技術 ,  病因
準シソーラス用語： ゲノム注釈 ,  *ゲノム配列 ,  遺伝子配列決定

分類 (2件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： シークエンシング ,  植物 ,  病原性真菌 ,  Rhizoctonia ,  ゲノム配列