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J-GLOBAL ID：201502253237074330   整理番号：15A0182065

重複する重要なモジュールに基づく重要蛋白質の予測

Prediction of Essential Proteins Based on Overlapping Essential Modules

著者 (5件)： ZHAO Bihai (Central South Univ., Changsha, CHN) ,  WANG Jianxin (Central South Univ., Changsha, CHN) ,  LI Min (Central South Univ., Changsha, CHN) ,  WU Fang-xiang (Univ. Saskatchewan, SK, CAN) ,  PAN Yi (Georgia State Univ., GA, USA)
資料名： IEEE Transactions on Nanobioscience  (IEEE Transactions on Nanobioscience)
巻： 13  号： 4  ページ： 415-424  発行年： 2014年12月 
JST資料番号： W1381A  ISSN： 1536-1241  CODEN： ITMCEL  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子発現プロファイルと組み合わせて,POEMと名づけた重複する重要なモジュールに基づく新規な重要蛋白質(ハブ)を予測する方法を提案する。POEMは元の蛋白質のインタラクトームネットワークを多くの重複する重要なモジュールに分割し,古典的な中心性測定およびPeCとCoEWCという新たに提案した重要蛋白質の予測方法よりも優れていた。実験結果は,重要蛋白質の予測の精度が蛋白質のモジュール性とネットワークトポロジー特徴を伴う遺伝子発現プロファイルを組合せることによって改善した。

シソーラス用語： *生物相互作用 ,  *予測 ,  モジュール ,  遺伝子発現 ,  酵母 ,  同定 ,  *タンパク質 ,  ネットワーク ,  位相幾何学 ,  輪郭
準シソーラス用語： *インタラクトーム ,  遺伝子発現プロファイル ,  トポロジー ,  プロファイル【輪郭】 ,  POEM ,  PeC ,  CoEWC

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  その他の情報処理  (JE15050M)

タイトルに関連する用語 (3件)： モジュール ,  蛋白質 ,  予測