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J-GLOBAL ID：201502255007078738   整理番号：15A0435053

sbv IMPROVER種翻訳課題における蛋白質リン酸化の種間予測

Inter-species prediction of protein phosphorylation in the sbv IMPROVER species translation challenge

著者 (10件)： BIEHL Michael (Univ. Groningen, Groningen, NLD) ,  SADOWSKI Peter (Univ. California, CA) ,  BHANOT Gyan (Rutgers Univ., NJ) ,  BILAL Erhan (IBM, NY) ,  DAYARIAN Adel (Univ. California, CA, USA) ,  MEYER Pablo (IBM, NY) ,  NOREL Raquel (IBM, NY) ,  RHRISSORRAKRAI Kahn (IBM, NY) ,  ZELLER Michael D. (Univ. California, CA) ,  HORMOZ Sahand (Univ. California, CA, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 4  ページ： 453-461  発行年： 2015年02月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの異なる化学刺激に曝露されたヒト気管支上皮細胞における蛋白質リン酸化の予測に対し,研究におけるプロセス検証のための工業的方法に対するシステムバイオロジー検証(sbv IMPROVER)が開発された。2つのチームが,データ駆動手法および計算法を示した,そのうえ,参加者および課題まとめ役により,データセットおよび課題結果のポストホック分析が行われた。ラットリン酸化に基づいたヒトにおける蛋白質リン酸化状態の予測成功は,実現可能であることを課題結果が示した。しかし,用いられた計算ツールの制限内において,遺伝子発現の介在は予測品質を改善しなかった。時間特異性測定のポストホック分析は,ラットおよびヒト両種におけるシグナル伝達経路を明らかにした。

シソーラス用語： *生物学 ,  *計算機科学 ,  *リン酸化 ,  *翻訳後修飾 ,  *予測 ,  化学刺激 ,  上皮細胞 ,  気管支 ,  データフロー制御 ,  計算 ,  集合 ,  データ ,  ラット ,  ヒト ,  遺伝子発現 ,  経路 ,  細胞情報伝達
準シソーラス用語： シグナル伝達経路 ,  *システムバイオロジー ,  データセット ,  データ駆動 ,  気管支上皮細胞 ,  計算法 ,  *蛋白質リン酸化

分類 (4件)： 生物科学研究法一般  (EA03010K) ,  計算機利用技術一般  (JE01000C) ,  付加反応,脱離反応  (CF02030M) ,  代謝一般  (EB03050F)

タイトルに関連する用語 (3件)： 翻訳 ,  蛋白質リン酸化 ,  予測