454配列データのための隣接種子を基にした発見的クラスタリング手法【Powered by NICT】

Chen Wei; Cheng Yongmei; Zhang Shaowu; Pan Quan

文献

J-GLOBAL ID：201502258018551817 整理番号：14A1422025

454配列データのための隣接種子を基にした発見的クラスタリング手法【Powered by NICT】

Heuristic Clustering Method Based on Neighbor-Seeds for 454 Sequencing Data

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資料名：
巻： 25 号： 5 ページ： 929-938 発行年： 2014年
JST資料番号： C2542A ISSN： 1000-9825 CODEN： RUXUEW 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

次世代シークエンシング技術の発展に伴い,多数の16S rRNA遺伝子読み取りのを収集した。鍵と重要な問題は,それらのデータ間の隠れた情報のマイニングのための新しい方法を開発することである。配列クラスタリングは,種,微生物群集の機能的及び構造的多様性を理解することを助けることができる大規模データの自然グループを見出すことを目指した。本研究では,454の塩基配列データのための,NbHClustと命名した傍種子に基づく発見的クラスタリング法を提案する。結果は,この方法は,操作的分類単位(OTU)の過大評価の程度を低減し,ロバスト性の良い高クラスタリング精度を持つことができることを示した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

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