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J-GLOBAL ID：201502261192666047   整理番号：15A0286641

全がん解析:全がんネットワーク解析によって,経路やタンパク質複合体に見いだされるまれな体細胞変異の組み合わせが見つかった

Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes

著者 (21件)： LEISERSON Mark D M (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  VANDIN Fabio (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  WU Hsin-Ta (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  DOBSON Jason R (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  ELDRIDGE Jonathan V (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  THOMAS Jacob L (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  PAPOUTSAKI Alexandra (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  KIM Younhun (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  RAPHAEL Benjamin J (Brown Univ., Rhode Island, USA) ,  NIU Beifang (Washington Univ. in St. Louis, Missouri, USA) ,  MCLELLAN Michael (Washington Univ. in St. Louis, Missouri, USA) ,  DING Li (Washington Univ. in St. Louis, Missouri, USA) ,  LAWRENCE Michael S (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  GETZ Gad (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  GONZALEZ-PEREZ Abel (Univ. Pompeu Fabra, Barcelona, ESP) ,  TAMBORERO David (Univ. Pompeu Fabra, Barcelona, ESP) ,  LOPEZ-BIGAS Nuria (Univ. Pompeu Fabra, Barcelona, ESP) ,  CHENG Yuwei (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  RYSLIK Gregory A (Yale School of Public Health, Connecticut, USA) ,  LOPEZ-BIGAS Nuria (Institutetucio Catalana de Recerca i Estudis Avancats (ICREA), Barcelona, ESP) ,  GETZ Gad (Massachusetts General Hospital, Massachusetts, USA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 47  号： 2  ページ： 106-114  発行年： 2015年02月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： がんに含まれる変異は均質ではなく,その結果として生じるロングテール現象は,がんで有意に変異する遺伝子や経路の発見を難しくしている。今回,変異したネットワークを見つけるために,新たなアルゴリズムHotNet2を用いて全がん解析を行った。解析対象は,がんゲノムアトラス(TCGA)の12種類のがん由来の3281個の試料である。HotNet2は,複数の変異したサブネットワークを見つけるアルゴリズムであり,既存の単一遺伝子,単一経路,単一ネットワーク検出アプローチの問題点を克服している。今回の全がん解析によって,有意に変異が生じたサブネットワークを16個同定した。これらのサブネットワークには,がんとの関連がよく知られているシグナル伝達経路や,がんにおける特徴的な役割がそれほど知られていないコヒーシンやコンデンシンなどをはじめとするサブネットワークも含まれていた。同定されたサブネットワークの多数には,多くの試料にわたって同時に生じた変異が見つかった。また,これらのサブネットワークには,まれな体細胞変異を持つ遺伝子が多数,複数のがんにわたって含まれていた。こういった遺伝子の大部分ががんに関与していることを示すさらなる証拠が得られている。まれな変異のさまざまな組み合わせを新たに明らかにした今回の全がんネットワーク解析は,あらゆる種類のがんに対する診断および治療のチャンスを新たに模索するための指針となる。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： *発癌 ,  タンパク質複合体 ,  アルゴリズム ,  ヒト ,  *突然変異 ,  *ネットワーク ,  細胞情報伝達 ,  癌遺伝子 ,  癌タンパク質 ,  腫瘍
準シソーラス用語： HotNet2 ,  コヒーシン ,  コンデンシン ,  サブネットワーク ,  ネットワーク解析 ,  *遺伝子ネットワーク ,  *体細胞変異

分類 (2件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

タイトルに関連する用語 (7件)： がん ,  解析 ,  ネットワーク解析 ,  経路 ,  タンパク質複合体 ,  体細胞変異 ,  組み合わせ