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J-GLOBAL ID：201502261804608483   整理番号：15A0615295

化学的類似性を使った代謝ネットワークの効率的探索とアノテーション

Efficient searching and annotation of metabolic networks using chemical similarity

著者 (4件)： PERTUSI Dante A. (Northwestern Univ., IL, USA) ,  STINE Andrew E. (Northwestern Univ., IL, USA) ,  BROADBELT Linda J. (Northwestern Univ., IL, USA) ,  TYO Keith E. J. (Northwestern Univ., IL, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 7  ページ： 1016-1024  発行年： 2015年04月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 有用な化学物質生成に関与する大きな代謝ネットワークの推定探索法であるグラフ的アルゴリズムに代わる方法として,SimIndex(SI)とSimZymeの二つの方法を開発した。これらは2D化学的フィンガープリントを利用し,従来法より多くの化学物質についての適用が可能である。SimIndex(SI)とSimZymeのパイソンファイルはウエブサイト http://tyolab.northwestern.edu/tools/ で入手できる。

シソーラス用語： 類似性 ,  *代謝経路 ,  *経路探索 ,  アノテーション ,  化学物質 ,  指紋 ,  オブジェクト指向言語
準シソーラス用語： Python言語 ,  フィンガープリント

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： 化学 ,  類似性 ,  代謝ネットワーク ,  探索 ,  アノテーション