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J-GLOBAL ID：201502263254987212   整理番号：15A0385880

アミノ酸取込および中心代謝に対する効果の評価のためのEnterococcus faecalis V583のゲノム規模代謝モデルの利用

Using a Genome-Scale Metabolic Model of Enterococcus faecalis V583 To Assess Amino Acid Uptake and Its Impact on Central Metabolism

著者 (11件)： VEITH Nadine (Heidelberg Univ., Heidelberg, DEU) ,  SOLHEIM Margrete (Norwegian Univ. Life Sci., Aas, NOR) ,  VAN GRINSVEN Koen W. A. (Univ. Amsterdam and Netherlands Inst. of Systems Biology, Amsterdam, NLD) ,  OLIVIER Brett G. (VU Univ. Amsterdam, Amsterdam, NLD) ,  LEVERING Jennifer (Heidelberg Univ., Heidelberg, DEU) ,  GROSSEHOLZ Ruth (Heidelberg Univ., Heidelberg, DEU) ,  HUGENHOLTZ Jeroen (Univ. Amsterdam and Netherlands Inst. of Systems Biology, Amsterdam, NLD) ,  HOLO Helge (Norwegian Univ. Life Sci., Aas, NOR) ,  NES Ingolf (Norwegian Univ. Life Sci., Aas, NOR) ,  TEUSINK Bas (VU Univ. Amsterdam, Amsterdam, NLD) ,  KUMMER Ursula (Heidelberg Univ., Heidelberg, DEU)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 81  号： 5  ページ： 1622-1633  発行年： 2015年03月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 院内感染や多剤耐性が問題となっているE.faecalisのゲノム情報に基づいて構築した代謝経路と代謝産物のモデル化により新規薬物ターゲットを検索した。嫌気性,グルコース制限下で培養したE.faecalisの培地および上清の最終代謝産物とアミノ酸量の測定結果に基づいて,アミノ酸取込および代謝フラックスを計算した。モデルの増殖および維持に関連したエネルギーパラメータは,Lactobacillus plantarumやL.lactisのゲノムスケールモデルと同程度であった。本モデルを用いたアミノ酸要求性に関する解析も行い,増殖に必要な7種類のアミノ酸を特定できた。グルタミンシンテターゼノックアウト変異株との比較により,野生株および変異株が異なる機構によりL-グルタミンの欠損を埋め合わせることが分かった。ゲノムスケール代謝モデルは,遺伝子,蛋白質および代謝反応間の関係性の研究に役立つとともに,新規薬物標的の発見にも有用である。

シソーラス用語： *大便連鎖球菌 ,  代謝産物 ,  *アミノ酸代謝 ,  代謝経路 ,  栄養素要求性 ,  ターゲット ,  *グルタミンシンテターゼ ,  遺伝子破壊 ,  形質転換 ,  生化学系モデル
準シソーラス用語： アミノ酸要求性 ,  メタボローム ,  薬物標的

分類 (1件)： 代謝と栄養  (EG03054K)

タイトルに関連する用語 (8件)： アミノ酸 ,  取込 ,  代謝 ,  評価 ,  Enterococcus ,  ゲノム ,  規模 ,  モデル