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J-GLOBAL ID：201502265341448037   整理番号：15A0022656

GOMA:GOモジュールに基づく機能的濃縮分析ツール【Powered by NICT】

GOMA:functional enrichment analysis tool based on GO modules

著者 (4件)： Huang Qiang (National Center for Mathematics and Interdisciplinary Sciences, Inst. of Applied Mathematics, Acad. of Mathematics ...) ,  Wu Lingyun (National Center for Mathematics and Interdisciplinary Sciences, Inst. of Applied Mathematics, Acad. of Mathematics ...) ,  Wang Yong (National Center for Mathematics and Interdisciplinary Sciences, Inst. of Applied Mathematics, Acad. of Mathematics ...) ,  Zhang Xiangsun (National Center for Mathematics and Interdisciplinary Sciences, Inst. of Applied Mathematics, Acad. of Mathematics ...)
資料名： Aizheng  (Aizheng)
巻： 32  号： 4  ページ： 195-204  発行年： 2013年 
JST資料番号： C2043A  ISSN： 1000-467X  CODEN： AIZHE4  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子セットの関数を分析するシステム生物学における高スループット実験の結果を解釈する際に重要な段階である。品種濃縮分析のツールが近年開発されているが,大部分はしばしば冗長,最も意味のある関数を抽出を困難にしていることを有意に濃縮された項の長いリストを出力する。GOMA,濃縮された機能的遺伝子オントロジー(GO)モジュールの新しい概念に基づく新規濃縮解析法を提示した。この方法を用いて,系統的に最適化モデルを介した機能的に類似なGO用語のグループ,機能性GOモジュールを明らかにし,次に濃縮スコアによりそれらをランク付けした。著者らの新しい方法は,冗長性を減少させることにより濃縮分析結果を単純化し,それにより機能的に類似した用語間の矛盾した濃縮結果を防ぎ,より生物学的に意味のある結果を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  一覧表 ,  *用語 ,  等級づけ ,  冗長性
準シソーラス用語： *解析ツール ,  システム生物学 ,  遺伝子オントロジー ,  スコア , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (3件)： モジュール ,  濃縮 ,  分析ツール