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J-GLOBAL ID：201502265729624732   整理番号：15A0613735

栽培種リクチワタ(Gossypium hirsutum TM-1)のゲノム配列がゲノムの進化を明らかにする

Genome sequence of cultivated Upland cotton (Gossypium hirsutum TM-1) provides insights into genome evolution

著者 (40件)： LI Fuguang (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  LU Cairui (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  ZOU Changsong (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  SHANG Haihong (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  MA Xiongfeng (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  WU Jianyong (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  LIU Kun (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  YANG Weihua (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  DU Xiongming (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  YUAN Youlu (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  YE Wuwei (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  ZHANG Xueyan (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  WEI Hengling (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  WEI Shoujun (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  CUI Jinjie (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  SONG Guoli (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  WANG Kunbo (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  YU Shuxun (Chinese Acad. of Agricultural Sci., Anyang, CHN) ,  FAN Guangyi (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LIANG Xinming (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  CHEN Wenbin (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  SHI Chengcheng (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LIU Xin (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LIU Weiqing (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  HUANG Guodong (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  ZHANG He (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  SUN Fengming (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LIANG Jie (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  WANG Jiahao (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  HE Qiang (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  HUANG Leihuan (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  WANG Jun (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  XU Xun (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  XIAO Guanghui (Peking Univ., Beijing, CHN) ,  HUANG Gai (Peking Univ., Beijing, CHN) ,  ZHU Yuxian (Peking Univ., Beijing, CHN) ,  XIAO Guanghui (Wuhan Univ., Wuhan, CHN) ,  HUANG Gai (Wuhan Univ., Wuhan, CHN) ,  ZHU Yuxian (Wuhan Univ., Wuhan, CHN) ,  KOHEL Russell J (Agricultural Res. Serv., US Dep. of Agriculture (ARS, USDA), Texas, USA)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 33  号： 5  ページ： 524-530  発行年： 2015年05月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： リクチワタ(Gossypium hirsutum)は,その複雑な四倍体(A_tD_t)ゲノムのために塩基配列解読が容易でないことが分かっている。今回我々は,181倍のペアエンド配列を用い,5倍のBAC-to-BAC配列および高分解能の遺伝子地図も援用することにより,概要ゲノムを得た。今回のアセンブリーでは,A_tD_tゲノムの89.6~96.7%をカバーする2173Mbのスキャフォールドの88.5%に関して,偽染色体26本の上で位置および向きが確認された。このリクチワタA_tD_tゲノムと,解読済みの二倍体Gossypium arboreum(AA)およびGossypium raimondii(DD)のゲノムの比較から,遺伝子の順序が保存されていることが明らかにされた。A_tD_tゲノムの67.2%は反復配列が占めており,D_t由来の転移因子はA_t由来のものと比較して活動的とみられた。A_tD_tのゲノムサイズは,異質倍数化後に縮小していた。AゲノムまたはA_tゲノムは,繊維形質に関する正の選択を受けていたと考えられる。セルロースシンターゼ(CesA)ならびに1-アミノシクロプロパン-1-カルボン酸オキシダーゼ1および3(ACO1,3)の異なる調節機構の協調進化は,G.hirsutumの繊維生産の促進に重要と考えられる。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： *ワタ ,  *ヌクレオチド配列 ,  ゲノム ,  *グルコシルトランスフェラーゼ ,  *カルボニルオキシドレダクターゼ ,  *工業生産 ,  四倍体 ,  遺伝子 ,  栽培品種 ,  遺伝情報 ,  ベクター ,  染色体 ,  遺伝子地図 ,  反復配列 ,  転移性遺伝要素 ,  改変
準シソーラス用語： *リクチワタ ,  Gossypium hirsutum ,  *ゲノム配列 ,  *セルロースシンターゼ ,  *1-アミノシクロプロパン-1-カルボン酸オキシダーゼ1 ,  *1-アミノシクロプロパン-1-カルボン酸オキシダーゼ3 ,  アミノシクロプロパンカルボン酸オキシダーゼ ,  *繊維生産 ,  CesA遺伝子 ,  ACO1遺伝子 ,  ACO3遺伝子 ,  栽培種 ,  ゲノム解読 ,  ペアエンド配列 ,  BAC【染色体】 ,  転移因子 ,  異質倍数化 ,  倍数化

分類 (3件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  作物の品種改良  (FC02030G)

タイトルに関連する用語 (6件)： 栽培種 ,  Gossypium ,  Tm ,  ゲノム配列 ,  ゲノム ,  進化