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J-GLOBAL ID：201502266940532620   整理番号：15A0290979

Streptomyces albidoflavusの集団遺伝学的解析は放線菌類多様化における相同組換に対する生息場所障壁を明らかにする

Population Genetic Analysis of Streptomyces albidoflavus Reveals Habitat Barriers to Homologous Recombination in the Diversification of Streptomycetes

著者 (7件)： CHENG Kun (Inst. of Microbiology, Chinese Acad. of Sci., Beijing, CHN) ,  CHENG Kun (Univ. Chinese Acad. of Sci., Beijing, CHN) ,  RONG Xiaoying (Inst. of Microbiology, Chinese Acad. of Sci., Beijing, CHN) ,  PINTO-TOMAS Adrian A. (Univ. Costa Rica, San Jose, CRI) ,  FERNANDEZ-VILLALOBOS Marcela (Univ. Costa Rica, San Jose, CRI) ,  MURILLO-CRUZ Catalina (Univ. Costa Rica, San Jose, CRI) ,  HUANG Ying (Inst. of Microbiology, Chinese Acad. of Sci., Beijing, CHN)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 81  号： 3  ページ： 966-975  発行年： 2015年02月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 昆虫,海あるいは土壌由来の抗生物質産生関連Streptomyces albidoflavus 41株分離株のハウスキーピング遺伝子atpD,gyrB,recA,rpoBおよびtrpBの多座位配列タイピング(MLSA)を行った。MLSA結果のペアワイスホモプラシー試験,系統学的解析,下平-長谷川検定およびネットワーク解析から,S.albidoflavusの進化的高頻度相同組換は類推された。各生息地ごとの分離株の系統学的解析およびベイジアンクラスタリングにより,生息場所の違いがS.albidoflavusの集団構造に強く影響することが分かった。宿主,生息環境由来のS.albidoflavusのうち,昆虫由来菌の遺伝子流動が最も少なく,進化的多様化における相同組換および生息場所障壁の重要な役割を示唆した。

シソーラス用語： *ハウスキーピング遺伝子 ,  遺伝学実験技術 ,  制約条件 ,  相同性 ,  系統発生 ,  統計解析 ,  統計的推定 ,  Bayes推定 ,  宿主域 ,  生息場所 ,  *相同組換 ,  *Streptomyces ,  *抗生物質産生菌 ,  集団遺伝
準シソーラス用語： *Streptomyces albidoflavus ,  ホモプラシー ,  ペアワイズ制約 ,  遺伝的構造 ,  下平-長谷川検定 ,  多座位配列タイピング

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  抗生物質産生菌  (GX02000L)

タイトルに関連する用語 (8件)： Streptomyces ,  集団遺伝学 ,  解析 ,  放線菌類 ,  多様化 ,  相同組換 ,  生息場所 ,  障壁