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J-GLOBAL ID：201502266953006714   整理番号：15A0461471

蛋白質-リガンド親和性を推定するための注入-メタ動力学および溶液NMR

Funnel-Metadynamics and Solution NMR to Estimate Protein-Ligand Affinities

著者 (6件)： TROUSSICOT Laura (Univ. de Lyon, Villeurbanne, FRA) ,  GUILLIERE Florence (Univ. de Lyon, Villeurbanne, FRA) ,  LIMONGELLI Vittorio (Universita della Svizzera Italiana (USI), Lugano, CHE) ,  LIMONGELLI Vittorio (Univ. Naples “Federico II”, Naples, ITA) ,  WALKER Olivier (Univ. de Lyon, Villeurbanne, FRA) ,  LANCELIN Jean-Marc (Univ. de Lyon, Villeurbanne, FRA)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 137  号： 3  ページ： 1273-1281  発行年： 2015年01月28日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 原子解像度レベルでの分子結合過程の総合理解は,適切な時間スケールでのシステムダイナミックスおよび統計学の記述を要する。溶液NMRオブザーバブルは異なる時間スケールで平均化されるが,最近の分子動力学は現実的モデルシステムのシミュレーション時間をかなり促進した。ヒトパーオキシレドキシン5に対し結晶学またはNMRのいずれかにより最近発見された既知リガンドに基づいて,注入-メタ動力学シミュレーションおよび溶液NMR実験により推定された結合自由エネルギーを比較して原子解像度レベルにおいてそれらの親和性を正確に評価した。

シソーラス用語： *分子間相互作用 ,  *タンパク質 ,  *親和性 ,  *動力学 ,  *NMR【磁気共鳴】 ,  原子 ,  分解能 ,  システムダイナミックス ,  統計学 ,  オブザーバブル ,  規模 ,  経時変化 ,  時間 ,  分子動力学 ,  シミュレーション ,  ペルオキシダーゼ ,  結晶学 ,  配位子 ,  自由エネルギー ,  化学結合
準シソーラス用語： リガンド【配位子】 ,  ペルオキシレドキシン ,  解像度 ,  結合自由エネルギー ,  時間スケール ,  *蛋白質リガンド相互作用 ,  *溶液NMR

分類 (3件)： 分子間相互作用  (BH07020P) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  NMR一般  (BM07041R)

タイトルに関連する用語 (7件)： 蛋白質 ,  リガンド ,  親和性 ,  推定 ,  注入 ,  動力学 ,  溶液NMR