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J-GLOBAL ID：201502267056489032   整理番号：15A0704966

機能喪失型バリアント:8,554人における機能喪失型バリアントおよび20のリスク因子表現型を解析し,慢性疾患に影響を及ぼす座位を同定する

Analysis of loss-of-function variants and 20 risk factor phenotypes in 8,554 individuals identifies loci influencing chronic disease

著者 (18件)： LI Alexander H (Univ. Texas Health Sci. Center, Texas, USA) ,  MORRISON Alanna C (Univ. Texas Health Sci. Center, Texas, USA) ,  POLFUS Linda M (Univ. Texas Health Sci. Center, Texas, USA) ,  YU Bing (Univ. Texas Health Sci. Center, Texas, USA) ,  LIU Xiaoming (Univ. Texas Health Sci. Center, Texas, USA) ,  BOERWINKLE Eric (Univ. Texas Health Sci. Center, Texas, USA) ,  KOVAR Christie (Baylor Coll. of Medicine, Texas, USA) ,  METCALF Ginger (Baylor Coll. of Medicine, Texas, USA) ,  MUZNY Donna (Baylor Coll. of Medicine, Texas, USA) ,  VEERARAGHAVAN Narayanan (Baylor Coll. of Medicine, Texas, USA) ,  GIBBS Richard A (Baylor Coll. of Medicine, Texas, USA) ,  BOERWINKLE Eric (Baylor Coll. of Medicine, Texas, USA) ,  CUPPLES L Adrienne (National Heart, Lung, and Blood Inst. (NHLBI) Framingham Heart Study, Massachusetts, USA) ,  CUPPLES L Adrienne (Boston Univ. School of Public Health, Massachusetts, USA) ,  BRODY Jennifer A (Univ. Washington, Washington, USA) ,  LUMLEY Thomas (Univ. Washington, Washington, USA) ,  LUMLEY Thomas (Univ. Auckland, Auckland, NZL) ,  MOSLEY Thomas H (Univ. Mississippi Medical Center, Mississippi, USA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 47  号： 6  ページ： 640-642  発行年： 2015年06月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 標準的なヒトエクソームに存在する多くの機能喪失型バリアントは,疾患発症リスクを低下させ,薬効に影響する可能性がある。本論文では機能喪失型バリアントが,心血管疾患や糖尿病などのよくある慢性疾患のリスク因子レベルや発症を左右する遺伝子群に多く存在すると仮定した。この仮説を検証するため,8,554人分のエクソームを配列決定し,機能喪失型バリアントが及ぼす20の慢性疾患リスク因子の表現型に対する影響を解析した。このエクソーム配列データセットを二分して,発見解析と再現解析を行ったところ,すでに関連が報告されている遺伝子における2種類の関連(PCSK9とAPOC3)が確認され,新たに8つの座位が同定された。これまで明らかになっておらず今回初めて判明した関連には,以下のようなものがある。TXNDC5のヘテロ接合性機能喪失型バリアントを持つ人において,空腹時血糖値の上昇が認められた。TXNDC5は,1型糖尿病進行のバイオマーカーをコードしている。また,C1QTNF8の機能喪失型バリアントにおいて,血清マグネシウムレベルに対する明らかな劣性効果が認められた。上記の結果から,詳細な表現型が知られている個人の大規模な配列データセットにおいて,遺伝子機能を左右するバリアントのアノテーションを行うことが,新たな遺伝子探索に有用であると証明された。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： ヒト ,  *危険因子 ,  表現型 ,  変異 ,  ゲノム ,  ヌクレオチド配列 ,  *遺伝子座 ,  LOH【遺伝】 ,  バイオマーカー ,  劣性 ,  対立遺伝子 ,  病気
準シソーラス用語： エクソーム ,  *機能喪失型対立遺伝子 ,  慢性疾患

分類 (1件)： 遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： バリアント ,  リスク因子 ,  表現型 ,  解析 ,  慢性疾患 ,  座位 ,  同定