文献

J-GLOBAL ID：201502270005766300   整理番号：15A0502786

超並列シーケンサーを用いたメタジェネティクスによるカイアシ類の群集構造解析

Metagenetic community analysis of copepods using high throughput sequencing

著者 (6件)： 平井惇也 (水産総合研究セ 中央水産研) ,  下出信次 (横浜国大 大学院環境情報研究院) ,  栗山美樹子 (水産総合研究セ 中央水産研) ,  市川忠史 (水産総合研究セ 中央水産研) ,  日高清隆 (水産総合研究セ 中央水産研) ,  津田敦 (東大 大気海洋研)
資料名： 日本プランクトン学会報  (Bulletin of Plankton Society of Japan)
巻： 62  号： 1  ページ： 73-78  発行年： 2015年02月25日 
JST資料番号： Y0113A  ISSN： 0387-8961  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 浮遊性カイアシ類は,海洋で卓越する動物プランクトンであり,食物網や物質循環において重要な役割を果たしている。また浮遊性カイアシ類は既知種だけで2,500種を越える多様性に富んだ生物群であり,生物多様性や環境評価を示す指標生物としてもしばしば取り扱われる。本研究では,超並列シーケンサーを使ったメタジェネティクスによる浮遊性カイアシ類の群集構造の解析手法を確立することを目的とし,カイアシ類のメタジェネティクスのための遺伝子領域の検討等を行った。

シソーラス用語： *カイアシ類 ,  *構造解析 ,  *遺伝学 ,  *自動分析計 ,  動物プランクトン ,  海洋循環 ,  生物多様性 ,  ヌクレオチド配列 ,  rRNA ,  バイオマーカー ,  *群集構造 ,  *次世代シーケンサー ,  食物網 ,  海洋物質循環 ,  28S rRNA ,  遺伝子座調節領域 ,  遺伝子マーカ ,  *無脊椎動物 ,  *自然科学
準シソーラス用語： *ジェネティクス ,  遺伝子制御領域 ,  遺伝マーカー

分類 (2件)： プランクトン  (FH02050R) ,  動物生態学一般  (EE03010W)

引用文献 (19件)：

• Beaugrand, G., K. M. Brander, J. A. Lindley, S. Souissi & P. C. Reid 2003. Plankton effect on cod recruitment in the North Sea. Nature 426: 661-664.
• Beaugrand, G., P. C. Reid, F. Ibañez, J. A. Lindley & M. Edwards 2002. Reorganization of North Atlantic marine copepod biodiversity and climate. Science 296: 1692-1694.
• Bucklin, A., S. Nishida, S. Schnack-Schiel, P. H. Wiebe, D. Lindsay, R. J. Machida & N. J. Copley 2010. A census of zooplankton of the global ocean, pp. 247-265. In Marine Life: Diversity, Distribution, and Abundance. (ed. McIntyre, A). Wiley-Blackwell, Oxford.
• Bucklin, A., D. Steinke & L. Blanco-Bercial 2011. DNA barcoding of marine metazoa. Ann. Rev. Mar. Sci. 3: 471-508.
• Edgar, R. C., B. J. Haas, J. C. Clemente, C. Quince & R. Knight 2011. UCHIME improves sensitivity and speed of chimera detection. Bioinformatics 27: 2194-2200.

タイトルに関連する用語 (5件)： シーケンサー ,  ジェネティクス ,  カイアシ類 ,  群集構造 ,  解析