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J-GLOBAL ID：201502273845530306   整理番号：15A0298328

switchBox:kトップスコアリングペア(k-Top Scoring Pair)分類子開発のためのRパッケージ

switchBox: an R package for k-Top Scoring Pairs classifier development

著者 (4件)： AFSARI Bahman (Johns Hopkins Univ., MD) ,  FERTIG Elana J. (Johns Hopkins Univ., MD) ,  GEMAN Donald (Johns Hopkins Univ., MD) ,  MARCHIONNI Luigi (Johns Hopkins Univ., MD)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 2  ページ： 273-274  発行年： 2015年01月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： kトップスコアリングペア(k-Top Scoring Pair,kTSP)は,対測定に基づくハイスループットなデータを用いた,予測のためのクラス分け法である。ここではkTSPベースの予測のためのRパッケージ「switchBox」について解説した。kTSPは,その前身トップスコアリングペア(Top Scoring Pair,TSP)と同様に,特徴に関する小さなサブセットのランク付けのみに依存しており,ノイズに強く,TSPとは対照的に,標準的なゲノム科学のクラス分け法に相当する正確さが備わっている。「switchBox」は,http://www.bioconductor.orgから利用可能である。

シソーラス用語： スループット ,  データ ,  予測 ,  遺伝学 ,  サポートベクトルマシン ,  DNAマイクロアレイ ,  予測技法 ,  *ソフトウェア
準シソーラス用語： kトップスコアリングペア ,  *Rパッケージ ,  switchBox ,  ゲノム科学 ,  コンピュータプログラム ,  トップスコアリングペア ,  ハイスループット ,  プログラム開発 ,  マイクロアレイ解析 ,  *分類子 ,  分類法

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 分類子 ,  開発 ,  Rパッケージ