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J-GLOBAL ID：201502277044659710   整理番号：15A0574646

M-path 潜在的代謝経路をナビゲーティングするためのコンパス

M-path: a compass for navigating potential metabolic pathways

著者 (9件)： ARAKI Michihiro (Kobe Univ., Kobe, JPN) ,  COX Robert Sidney,III (Kobe Univ., Kobe, JPN) ,  MAKIGUCHI Hiroki (Mitsui Knowledge Ind.(MKI) Co., Osaka) ,  OGAWA Teppei (Mitsui Knowledge Ind.(MKI) Co., Osaka) ,  TANIGUCHI Takeshi (MCHC R&D Synergy Center, Inc., Yokohama, JPN) ,  MIYAOKU Kohei (Mitsubishi Chemical Group Sci. and Technol. Res. Center(MCRC) Inc., Yokohama, JPN) ,  NAKATSUI Masahiko (Kobe Univ., Kobe, JPN) ,  HARA Kiyotaka Y. (Kobe Univ., Kobe, JPN) ,  KONDO Akihiko (Kobe Univ., Kobe, JPN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 6  ページ： 905-911  発行年： 2015年03月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 代謝経路設計のためのいくつかの計算機法が報告されたが,計算上の複雑さが化学および酵素データの多様性を限定してきた。本報告では,推定上の酵素反応および化合物を含む合成代謝経路を探索するための計算機プラットホーム,M-pathを紹介した。M-pathは,潜在的合成代謝経路を見出すため化学および酵素データベースを効率的に利用させる繰り返しランダムアルゴリズムである。M-pathは探索空間を容易に制御し,徹底的に列挙する経路と比べて良好な性能を示した。また,Webに基づく経路ビュアーを開発し,化学的類似性に基づいた評価スコアにより広範な代謝経路をチェックした。

シソーラス用語： *代謝経路 ,  *計算機械 ,  *酵素反応 ,  データベース ,  化学 ,  酵素 ,  化合物 ,  *アルゴリズム ,  Web【情報システム】 ,  ソフトウェア ,  類似性 ,  化学データベース ,  ビューワーソフト
準シソーラス用語： ビュアー ,  *計算機

分類 (4件)： 代謝一般  (EB02030C) ,  計算機利用技術一般  (JE01000C) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  数値計算  (JE02000J)

タイトルに関連する用語 (3件)： 代謝経路 ,  ナビゲーティング ,  コンパス