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J-GLOBAL ID：201502280549478532   整理番号：15A0556953

Pb²⁺誘導性アルギニンキナーゼ不活性化および凝集のための動力学を統合する分子動力学シミュレーション

Molecular dynamics simulations integrating kinetics for Pb²⁺-induced arginine kinase inactivation and aggregation

著者 (9件)： SI Yue-Xiu (Coll. of Biological and Environmental Sciences, Zhejiang Wanli Univ., Ningbo 315100, CHN) ,  LEE Jinhyuk (Korean Bioinformation Center (KOBIC), Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology, Daejeon 305-806, KOR) ,  LEE Jinhyuk (Dep. of Bioinformatics, Univ. of Sciences and Technol., Daejeon 305-350, KOR) ,  CAI Yan (Coll. of Biological and Environmental Sciences, Zhejiang Wanli Univ., Ningbo 315100, CHN) ,  YIN Shang-Jun (Coll. of Biological and Environmental Sciences, Zhejiang Wanli Univ., Ningbo 315100, CHN) ,  YANG Jun-Mo (Dep. of Dermatology, Sungkyunkwan Univ. School of Medicine, Samsung Medical Center, Seoul 135-710, KOR) ,  PARK Yong-Doo (Coll. of Biological and Environmental Sciences, Zhejiang Wanli Univ., Ningbo 315100, CHN) ,  PARK Yong-Doo (Zhejiang Provincial Key Lab. of Applied Enzymology, Yangtze Delta Region Inst. of Tsinghua Univ., Jiaxing 314006, CHN) ,  QIAN Guo-Ying (Coll. of Biological and Environmental Sciences, Zhejiang Wanli Univ., Ningbo 315100, CHN)
資料名： Process Biochemistry  (Process Biochemistry)
巻： 50  号： 5  ページ： 729-737  発行年： 2015年05月 
JST資料番号： C0250B  ISSN： 1359-5113  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 著者らは,Exopalaemon carinicauda(ECAK)とPb²⁺の間の分子動力学シミュレーションを行うために,ORF遺伝子配列に基づいてECAK由来アルギニンキナーゼの三次元構造を構築した。その結果,ECAKに対するPb²⁺の結合機構が結合部位から予測され,構造的変化が明らかになった。シミュレーション結果を確認するために,その後,Pb²⁺介在性ECAKの阻害および凝集が実施された。著者らは,Pb²⁺が比較的強く結合して,ECAKの活性を部分的に不活性化することを見出した。蛍光分析結果は,Pb²⁺が,ECAKの凝集によって直接誘導された実質的な疎水性表面の露出で,ECAKの三次構造変化を誘導することを示した。Pb²⁺で誘導されたECAKの凝集過程は,多相系動力学で起こった。浸透圧調整剤の添加は,Pb²⁺によるECAKの不活性化を保護しなかった。AK(アルギニンキナーゼ)は,無脊椎動物の細胞のエネルギー代謝に重要な役割を果たしているので,著者らの研究は,無脊椎動物にとって毒性を示すか,又は負の調節因子として作用する可能性のある凝集を含む,ECAKの酵素機能や非折畳みに対するPb²⁺の影響についての新しい情報を示唆している。Copyright 2015 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *鉛化合物 ,  *N-ホスホトランスフェラーゼ ,  *不活性化 ,  *凝集 ,  *計算機シミュレーション ,  *無脊椎動物 ,  遺伝子 ,  構造 ,  *蛍光分析 ,  *三次構造 ,  デコンボリューション ,  *エビ
準シソーラス用語： *アルギニンキナーゼ ,  ORF ,  *鉛(II) ,  三次元構造 ,  非折畳み ,  *分子動力学シミュレーション

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： アルギニンキナーゼ ,  不活性化 ,  凝集 ,  動力学 ,  統合 ,  分子動力学シミュレーション