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J-GLOBAL ID：201502285020469262   整理番号：15A0215307

Illuminaハイスループット配列決定により明らかにした水田土壌環境における浮遊大型水生植物の葉圏細菌群集

Phyllosphere Bacterial Community of Floating Macrophytes in Paddy Soil Environments as Revealed by Illumina High-Throughput Sequencing

著者 (4件)： XIE Wan-Ying (Inst. of Urban Environment, Chinese Acad. of Sci., Xiamen, CHN) ,  SU Jian-Qiang (Inst. of Urban Environment, Chinese Acad. of Sci., Xiamen, CHN) ,  ZHU Yong-Guan (Inst. of Urban Environment, Chinese Acad. of Sci., Xiamen, CHN) ,  ZHU Yong-Guan (Res. Center for Eco-Environmental Sci., Chinese Acad. of Sci., Beijing, CHN)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 81  号： 2  ページ： 522-532  発行年： 2015年01月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 水田土壌生態系における浮遊大型水生植物Wolffia australianaの葉圏細菌群集に関する16S rRNA遺伝子配列決定に基づいた研究を行った。葉圏,水及び土壌から採取したDNAを,Illumina HiSeq 2000プラットフォーム上で配列決定に供した。W.australiana葉圏は,陸生や沈水植物とは著しく異なった組成を持つ多様かつ特異な集団を保持した。肥沃化により主として制御された水中の生息地関連種選別及び物理化学的特性は,細菌群集形成の主要な駆動力であったが,土壌細菌群集では極めて限定されていた。葉圏におけるメチル栄養性及び脱窒に関与する群に属する細菌分類群は,C及びN生物地球化学における潜在的ホットスポットとしての水性浮遊植物の重要性を示した

シソーラス用語： *水生植物 ,  生態系 ,  葉 ,  *ミクロフローラ ,  遺伝学実験技術 ,  ヌクレオチド配列 ,  水田土 ,  生息環境 ,  ウキクサ科 ,  rRNA遺伝子 ,  ゲノム ,  生物多様性 ,  統計解析 ,  土壌細菌 ,  細菌
準シソーラス用語： 16S rRNA遺伝子 ,  Asticcacaulis ,  Bacteroidetes ,  Methylibium ,  Methylophilus ,  Wolffia australiana ,  アシドボラックス ,  ハイスループットヌクレオチド配列決定 ,  プロテオバクテリア ,  ミクロビオーム ,  *細菌群集 ,  細菌群集構造 ,  冗長性解析 ,  葉圏

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  異種生物間相互作用  (EE01050A)

タイトルに関連する用語 (8件)： ハイスループット ,  水田 ,  土壌環境 ,  浮遊 ,  大型 ,  水生植物 ,  葉圏 ,  細菌群集