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J-GLOBAL ID：201502285937367892   整理番号：15A0635890

水平遺伝子導入の存在における遺伝子系統図誤り訂正の改善

Improved gene tree error correction in the presence of horizontal gene transfer

著者 (7件)： BANSAL Mukul S. (Massachusetts Inst. Technol., MA, USA) ,  BANSAL Mukul S. (Univ. Connecticut, CT, USA) ,  WU Yi-Chieh (Massachusetts Inst. Technol., MA, USA) ,  ALM Eric J. (Massachusetts Inst. Technol., MA, USA) ,  ALM Eric J. (Broad Inst., MA, USA) ,  KELLIS Manolis (Massachusetts Inst. Technol., MA, USA) ,  KELLIS Manolis (Broad Inst., MA, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 8  ページ： 1211-1218  発行年： 2015年04月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 水平遺伝子導入の存在における遺伝子系統図誤り訂正に対する今回の新しい方法は水平遺伝子導入,遺伝子重複および損失をモデル化し,統計的仮説検定フレームワークを用いて既知の種系統図からのトポロジー情報と配列尤度を釣り合わせた。水平遺伝子導入ファミリーに応用されたとき現状の系統発生法は不正確な遺伝子系統図を生じ,今回の方法は遺伝子系統図の精度を劇的に改善することをシミュレーション研究において示した。

シソーラス用語： 分子遺伝現象 ,  *遺伝子導入 ,  *系統樹 ,  生物分類 ,  *遺伝子 ,  *誤り訂正 ,  遺伝子重複 ,  モデリング ,  仮説検定 ,  位相幾何学 ,  ヌクレオチド配列 ,  確率 ,  系統発生 ,  シミュレーション
準シソーラス用語： トポロジー ,  モデル化 ,  *遺伝子系統図 ,  *水平遺伝子導入 ,  尤度

分類 (2件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： 水平遺伝子導入 ,  遺伝子系統図 ,  誤り訂正