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J-GLOBAL ID：201502290466456761   整理番号：15A0563410

イルミナペアエンドシーケンシング技術を用いたトランスクリプトームプロファイリングおよびPEG処理に応答したラミー(Boehmeria nivea L. Gaud)における転写因子の同定

Transcriptome Profiling and Identification of Transcription Factors in Ramie (Boehmeria nivea L. Gaud) in Response to PEG Treatment, Using Illumina Paired-End Sequencing Technology

著者 (8件)： AN Xia (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  CHEN Jie (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  ZHANG Jingyu (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  LIAO Yiwen (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  DAI Lunjin (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  WANG Bo (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  LIU Lijun (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  PENG Dingxiang (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 16  号： 2  ページ： 3493-3511 (WEB ONLY)  発行年： 2015年02月 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 一般的に中国の草として知られているラミー(Boehmeria nivea L. Gaud)は,イラクサの多年生靭皮繊維植物である。中国では,ラミー農業,産業,貿易は約5万人のための収入を提供する。干ばつストレスはラミー茎の成長に大幅に影響を与え,ラミー繊維生産の劇的な低下を引き起こす。干ばつストレスにラミーの耐性を向上させる必要がある。しかし,ラミーにおける乾燥ストレス調節機構は不明である。ポリエチレングリコール(PEG)によって課された水ストレスは,植物の干ばつ耐性を評価するための一般的かつ便利な方法である。本研究では,PEG処理を行ったラミーからのcDNAコレクションのトランスクリプトーム解析を,1.7億の生のシーケンスを読み取るイルミナペアエンドシーケンシングを使用して行った。24(L2とR2)および72(L3とR3)時間PEG処理された葉と根では,16798遺伝子(葉では9281個,根では8627個)が異なって発現していた。これらの中でも,AP2(3),MYB(6),NAC(9),ジンクフィンガー(5),およびbZIP(2)ファミリーからなる25の転写因子(TFs)が干ばつストレスに関連すると考えられた。同定されたTFは,さらなるラミーにおける干ばつ適応を調査するために使用することができる。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *イラクサ科 ,  *水分ストレス ,  ポリエチレンオキシド ,  耐干性 ,  トランスクリプトーム ,  遺伝学実験技術 ,  葉 ,  根 ,  *転写因子 ,  遺伝子発現 ,  比率 ,  含水量 ,  ペルオキシダーゼ ,  アミノ酸 ,  窒素複素環化合物 ,  脂肪族アルデヒド
準シソーラス用語： *Boehmeria nivea ,  ペアエンドシークエンシング ,  *乾燥ストレス ,  相対含水率

分類 (2件)： 植物生理学一般  (EH02010Y) ,  繊維料作物  (FC03077U)

物質索引 (2件)： プロリン ,  マロンジアルデヒド

タイトルに関連する用語 (6件)： PEG ,  応答 ,  ラミー ,  Boehmeria ,  転写因子 ,  同定