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J-GLOBAL ID：201502293768647310   整理番号：15A0293602

蛋白質翻訳後修飾のソフトウェアアイ

Software eyes for protein post-translational modifications

著者 (2件)： NA Seungjin (Dep. of Computer Sci. and Engineering, Univ. of California, San Diego, La Jolla, CA, 92093; Center for Computational ...) ,  PAEK Eunok
資料名： Mass Spectrometry Reviews  (Mass Spectrometry Reviews)
巻： 34  号： 2  ページ： 133-147  発行年： 2015年04月 
JST資料番号： H0910A  ISSN： 0277-7037  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 翻訳後修飾(PTM)は細胞の複雑なプロセスのほぼ全面に対して重要である。PTMの同定はプロテオミクスの最大課題の1つであり,タンデム質量分析(MS/MS)のPTM分析に関する多くの計算研究がなされてきた。最も初期のPTM同定研究はデータベース検索ツールを用いて,MS/MSデータを蛋白質データベースに照合することにより行われてきたが,多数のPTMが検索パラメータとして与えられた場合は法外に遅い。ここでは,より多くの型のPTMを検索して,その検索を高速化する最近の開発について示した。そして,多重修飾ペプチドの同定または非制限モードによる全可能修飾の即時検索という観点から,多くの計算上の問題と解決策について考察した。蛋白質への官能基の共有結合付加を含むPTMの最も一般的な型とは異なるジスルフィド結合のようなPTMは,蛋白質の2つの異なる部分間の架橋を含む可能性があるため,分析のために専用のソフトウェアを必要とする。最後に,蛋白質ジスルフィド結合を同定する方法を示した。Copyright 2015 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *翻訳後修飾 ,  *ソフトウェア ,  タンデム質量分析 ,  プロテオミクス ,  *検索 ,  ジスルフィド結合 ,  ペプチド ,  アミノ酸配列
準シソーラス用語： *データベース検索

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 蛋白質 ,  翻訳後修飾 ,  ソフトウェア