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J-GLOBAL ID：201502295763889237   整理番号：15A0479928

Clostridium botulinumグループIIIの分子的遺伝子プロファイリングおよび様々なヨーロッパ諸国を起源とする天然の汚染サンプルにおけるその検出

Molecular Gene Profiling of Clostridium botulinum Group III and Its Detection in Naturally Contaminated Samples Originating from Various European Countries

著者 (17件)： WOUDSTRA Cedric (Food Safety Lab., Maisons-Alfort, FRA) ,  LE MARECHAL Caroline (Anses, Ploufragan, FRA) ,  LE MARECHAL Caroline (Univ. Europeenne de Bretagne, Rennes, FRA) ,  SOUILLARD Rozenn (Anses, Ploufragan, FRA) ,  SOUILLARD Rozenn (Univ. Europeenne de Bretagne, Rennes, FRA) ,  BAYON-AUBOYER Marie-Helene (LABOCEA, Ploufragan, FRA) ,  ANNIBALLI Fabrizio (National Reference Centre for Botulism, Rome, ITA) ,  AURICCHIO Bruna (National Reference Centre for Botulism, Rome, ITA) ,  DE MEDICI Dario (National Reference Centre for Botulism, Rome, ITA) ,  BANO Luca (Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie (IZSVe), Treviso, ITA) ,  KOENE Miriam (Central Veterinary Inst. (CVI) of Wageningen, Lelystad, NLD) ,  SANSONETTI Marie-Helene (Veterinary Diagnostic Lab., Paita, NCL) ,  DESOUTTER Denise (Veterinary Diagnostic Lab., Paita, NCL) ,  HANSBAUER Eva-Maria (Consultant Lab. for Clostridium botulinum, Berlin, DEU) ,  DORNER Martin B. (Consultant Lab. for Clostridium botulinum, Berlin, DEU) ,  DORNER Brigitte G. (Consultant Lab. for Clostridium botulinum, Berlin, DEU) ,  FACH Patrick (Food Safety Lab., Maisons-Alfort, FRA)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 81  号： 7  ページ： 2495-2505  発行年： 2015年04月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： C.botulinumグループIIIの遺伝的多様性を調べるためのリアルタイムPCRを用いた手法を開発し,ヨーロッパ各地から採取した560サンプルを用いて評価を行った。まず,Clostridium種間で高い遺伝的多様性を持つことが知られるフラジェリン遺伝子(fliC)に注目した。その主要な5つのサブタイプのうち,fliC-IはC/D型C.botulinumに汚染されたサンプルにおいてのみ検出できた。560サンプルにおいて,fliC-IIおよびfliC-IVは稀にしか検出されず,fliC-IIIおよびfliC-Vは検出されなかった。次に,ボツリヌス毒素遺伝子であるbont/C,bont/C/D,bont/D,およびbont/D/C遺伝子,非毒性ヘマグルチニン遺伝子ntnhを用いたPCRによるタイピング(C.novyi sensu lato検出系)を検討した。これらの遺伝子はC.novyiおよびC.haemolyticumを高精度に検出できた。fliCベースのPCR解析およびC.novyi sensu lato検出系を組み合わせた解析から,C.botulinumグループIIIの遺伝的多様性は,グループIおよびIIよりも小さいことが分かった。fliCベースのPCR解析およびC.novyi sensu lato検出系を組み合わせることで,従来法よりも正確にC.botulinumグループIIIの特徴付けが可能になると結論付けた。

シソーラス用語： *ボツリヌス菌 ,  Clostridium ,  *遺伝子発現 ,  生物多様性 ,  *リアルタイムPCR法 ,  ヨーロッパ ,  遺伝子 ,  フラゲリン ,  ボツリヌス毒素 ,  血球凝集素 ,  細菌検査 ,  アミノ酸配列
準シソーラス用語： bont遺伝子 ,  *Clostridium botulinum ,  Clostridium haemolyticum ,  Clostridium novyi ,  fliC遺伝子 ,  ntnh遺伝子 ,  ヘマグルチニン ,  *遺伝子プロファイル ,  遺伝的多様性

分類 (3件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (8件)： Clostridium ,  グループ ,  分子 ,  遺伝子プロファイリング ,  ヨーロッパ ,  起源 ,  汚染 ,  サンプル