特許
J-GLOBAL ID：201503012872271793
非天然型塩基を含むオリゴデオキシヌクレオチドの切断による5’末端リン酸化オリゴデオキシヌクレオチドの製造方法
発明者：
,
,
出願人/特許権者：
代理人 (2件)：
平木 祐輔
, 藤田 節
公報種別：再公表公報
出願番号（国際出願番号）：JP2013058349
公開番号（公開出願番号）：WO2013-150902
出願日： 2013年03月22日
公開日（公表日）： 2013年10月10日
要約：
非天然型塩基を含むデオキシヌクレオチドをDNA鎖に導入することにより、化学反応によって低コスト且つ簡単な実験操作でDNA鎖の切断を行い、結果として生じた末端がリン酸化されたオリゴデオキシヌクレオチドを提供する。 本発明は、求核剤と式Iで表されるオリゴデオキシヌクレオチドとを接触させることによって、式Iで表されるオリゴデオキシヌクレオチドに含まれる非天然型塩基を含むデオキシヌクレオシドBの3’位とCの5’末端との間のホスホジエステル結合が、Cの5’末端がリン酸化されたオリゴデオキシヌクレオチド部分がBの3’位から脱離することによって切断されて、5’末端がリン酸化されたオリゴデオキシヌクレオチドCを得る、5’末端リン酸化オリゴデオキシヌクレオチド形成工程を含む、オリゴデオキシヌクレオチドの製造方法に関する。
請求項（抜粋）：
求核剤と、式I:
(A)n-B-C
[式中、
Aは、オリゴデオキシヌクレオチドであり、
Bは、求核剤によって脱離可能な部分Eを有する、非天然型塩基を含むデオキシヌクレオシドであり、
Cはオリゴデオキシヌクレオチドであり、
nは0又は1であり、
nが1のとき、Aの3’末端とBの5’位とは、ホスホジエステル結合で連結されており、
Bの3’位とCの5’末端とは、ホスホジエステル結合で連結されており、
BとCとの間のホスホジエステル結合は、求核剤の攻撃によって誘発されるEの脱離に伴って、Cの5’末端がリン酸化されたオリゴデオキシヌクレオチド部分がBの3’位から脱離することによって切断される]
で表されるオリゴデオキシヌクレオチドとを接触させることによって、BとCとの間のホスホジエステル結合が、Cの5’末端がリン酸化されたオリゴデオキシヌクレオチド部分がBの3’位から脱離することによって切断されて、前記Cの5’末端がリン酸化されたオリゴデオキシヌクレオチドと、式II:
(A)n-B’
[式中、
A及びnは、式Iにおいて定義したのと同様の意味であり、
B’は、求核剤の攻撃によるEの脱離に伴って形成されるBの残基部分である]
で表されるオリゴデオキシヌクレオチドとを得る、5’末端リン酸化オリゴデオキシヌクレオチド形成工程を含む、オリゴデオキシヌクレオチドの製造方法。
IPC (5件)：
C12N 15/09
, C12Q 1/68
, C07H 19/073
, C07H 19/173
, C07H 21/04
C12N15/00 A
, C12Q1/68 A
, C07H19/073
, C07H19/173
, C07H21/04 A
4B024AA20
, 4B024CA01
, 4B024CA20
, 4B024HA08
, 4B063QQ42
, 4B063QR62
, 4B063QS25
, 4C057AA20
, 4C057BB02
, 4C057DD01
, 4C057DD03
, 4C057LL11
, 4C057LL17
, 4C057LL19
, 4C057LL37
, 4C057LL40
, 4C057LL42
, 4C057MM04
