- 2023 - 2028 北からの視点・考古科学分析・広域比較に基づく日本古墳築造の総合的研究
- 2021 - 2025 縄文時代の森林資源の管理と利用に含まれる多様な植物の解明
- 2021 - 2025 土器敷物圧痕の素材植物と編組技法から見た縄文時代の技術知の解明
- 2020 - 2025 総括班
- 2020 - 2025 土器に残る動植物痕跡の形態学的研究
- 2020 - 2025 土器を掘る:22世紀型考古資料学の構築と社会実装をめざした技術開発型研究 総括班
- 2020 - 2024 初期の縄文土器の機能に関する総合的研究
- 2019 - 2023 第三の発掘-人為化石が開拓する未来の考古資料学の構築
- 2019 - 2022 中部山岳地における縄文大型マメの継続性に関する研究
- 2017 - 2021 日韓新石器時代における鱗茎利用の時空間的変遷の解明
- 2016 - 2020 軟X線・X線CTを用いた栽培植物・家屋害虫のタフォノミーと縄文人の心象の解明
- 2016 - 2019 東日本における食糧生産の開始と展開の研究-レプリカ法を中心として-
- 2015 - 2019 縄文時代前半期における森林資源管理・利用体系の成立と植物移入の植物学的解明
- 2015 - 2018 縄文中期末の「人口激減」に関する同位体地球化学と形質人類学による総合的研究
- 2013 - 2017 中部山岳地縄文時代におけるマメ栽培化過程の解明
- 2013 - 2017 縄文時代の鱗茎類利用に関する植物考古学的研究
- 2013 - 2016 日本の縄文・弥生時代遺跡出土編組・繊維製品等素材の考古植物学的研究
- 2013 - 2016 植物・土器・人骨の分析を中心とした日本列島農耕文化複合の形成に関する基礎的研究
- 2013 - 2016 愛知県保美貝塚出土資料による考古学・人類学のコラボレーションモデルの構築と展開
- 2012 - 2016 先端技術を用いた東アジアにおける農耕伝播と受容過程の学際的研究
- 2012 - 2016 先史時代東日本における食料加工技術の研究
- 2012 - 2015 縄文時代前半期における森林資源利用体系の成立と植物移入の植物学的解明
- 2012 - 2014 縄文時代前半期における森林資源利用体系の成立と植物移入の植物学的解明
- 2008 - 2011 レプリカ・セム法による極東地域先史時代の植物栽培化過程の実証的研究
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