研究者
J-GLOBAL ID:201601015160259818   更新日: 2024年11月05日

檜垣 匠

ヒガキ タクミ | TAKUMI HIGAKI
所属機関・部署:
職名: 教授
ホームページURL (2件): https://higaki-lab.net/https://higaki-lab.net/english/
研究分野 (2件): 形態、構造 ,  植物分子、生理科学
研究キーワード (12件): 植物細胞 ,  生物画像解析 ,  バイオイメージング ,  バイオイメージインフォマティクス ,  アクチン繊維 ,  微小管 ,  膜交通 ,  液胞 ,  細胞分裂 ,  タバコBY-2細胞 ,  気孔 ,  シロイヌナズナ
競争的資金等の研究課題 (10件):
  • 2022 - 2028 先端バイオイメージング支援プラットフォーム
  • 2020 - 2023 気孔開閉運動を制御する膜小胞と微小管の多次元ライブセルAI画像解析
  • 2018 - 2023 葉の力学的最適化過程における細胞平面充填の画像計測数理解析
  • 2016 - 2021 先端バイオイメージング支援プラットフォーム
  • 2017 - 2019 ライブセルイメージング計測の大規模化による器官形態形成機構の解明
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論文 (122件):
  • Manami Ichita, Haruna Yamamichi, Takumi Higaki. Virtual staining from bright-field microscopy for label-free quantitative analysis of plant cell structures. 2024
  • Yuki Hitora, Mako Hokaguchi, Yusaku Sadahiro, Takumi Higaki, Sachiko Tsukamoto. Machine Learning Accelerates Screening of Osteoclast Differentiation Inhibitors from Natural Products. Journal of natural products. 2024
  • Michitaka Notaguchi, Manami Ichita, Takaya Kawasoe, Keina Monda, Ken-ichi Kurotani, Takumi Higaki, Koh Iba, Mimi Hashimoto-Sugimoto. The PATROL1 function in roots contributes to the increase in shoot biomass. Planta. 2024. 260. 5. 105-105
  • Afiifah Machfuudzoh, Weerasak Pitaksaringkarn, Ryo Koshiba, Takumi Higaki, Randeep Rakwal, Yusuke Ohba, Masashi Asahina, Shinobu Satoh, Hiroaki Iwai. At2-MMP is required for attenuation of cell proliferation during wound healing in incised Arabidopsis inflorescence stems. Plant & cell physiology. 2024
  • Ryota Horiuchi, Asuka Kamimura, Yuga Hanaki, Hikari Matsumoto, Minako Ueda, Takumi Higaki. Deep learning-based cytoskeleton segmentation for accurate high-throughput measurement of cytoskeleton density. 2024
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MISC (150件):
  • 松本光梨, KANG Zichen, 中川朔未, 野々山朋信, 石本志高, 檜垣匠, 津川暁, 植田美那子. ライブイメージングと数理モデルから迫る,シロイヌナズナ受精卵の極性的な伸長機構. 日本植物生理学会年会(Web). 2024. 65th
  • 松本朋子, 檜垣匠, 高塚大知, 朽名夏麿, 尾形義之, 馳澤盛一郎, 梅田正明, 稲田のりこ. シロイヌナズナのサブクラスIアクチン脱重合因子は細胞核内構造と遺伝子発現を制御する. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
  • LEE Hayoung, 森山奈津美, 野村康之, 檜垣匠, 佐藤綾人, 永野惇, 永野惇. ケミカルトランスクリプトミクスを用いた化合物に対する応答の網羅的解析. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
  • 菊川琴美, 今村寿子, 曽我康一, 小竹敬久, 檜垣匠. シロイヌナズナ子葉敷石細胞の多方向への平面成長は団扇型の子葉形態形成に寄与する. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
  • 松本光梨, 中川朔未, 檜垣匠, 津川暁, 石本志高, 野々山朋信, KANG Zichen, 植田美那子, 植田美那子. ライブイメージング解析から迫る,シロイヌナズナ受精卵の極性的な伸長機構. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
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特許 (3件):
書籍 (1件):
  • Photobook植物細胞の知られざる世界
    化学同人 2010 ISBN:4759811974
講演・口頭発表等 (215件):
  • 深層学習を利用した細胞骨格のセグメンテーション手法の検討
    (日本遺伝学会第95回大会 2023)
  • 気孔運動制御因子PATROL1およびSH3P3の細胞内動態および植物成長に対する効果
    (日本遺伝学会第95回大会 2023)
  • タバコBY-2細胞のM/G1境界期における表層微小管の再形成機構の解析
    (日本遺伝学会第95回大会 2023)
  • シロイヌナズナのサブクラスIアクチン脱重合因子は細胞核内構造と遺伝子発現を制御する
    (日本植物生理学会年会(Web) 2023)
  • ケミカルトランスクリプトミクスを用いた化合物に対する応答の網羅的解析
    (日本植物生理学会年会(Web) 2023)
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学位 (1件):
  • 博士(生命科学) (東京大学)
経歴 (6件):
  • 2022/04 - 現在 熊本大学 大学院先端科学研究部(理学系) 教授
  • 2021/10 - 2022/03 熊本大学 大学院先端科学研究部(理学系) 准教授
  • 2017/08 - 2021/09 熊本大学 国際先端科学技術研究機構 准教授
  • 2016/04 - 2017/07 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 特任准教授
  • 2011/04 - 2016/03 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 特任助教
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委員歴 (9件):
  • 2021/01 - 現在 日本バイオイメージング学会 理事
  • 2020/01 - 現在 Journal of Plant Research Editorial Board Member
  • 2017/06 - 現在 Frontiers in Plant Science Associate Editor
  • 2017/01 - 現在 日本バイオイメージング学会 評議員
  • 2017/01 - 現在 日本バイオイメージング学会 ホームページ編集委員
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受賞 (9件):
  • 2021/03 - 日本植物生理学会 日本植物生理学会奨励賞 画像解析技術の援用による植物細胞骨格研究
  • 2020/12 - 日本メンデル協会 CYTOLOGIA奨励賞 ライブイメージングと顕微鏡画像解析による植物細胞骨格の動態と機能の研究
  • 2017/09 - 日本植物学会 奨励賞 定量的画像解析に基づく植物細胞骨格の研究
  • 2017/04 - 日本バイオイメージング学会 Young Scientist Travel Award Quantitative cell biology of plant stomata
  • 2013/09 - 日本バイオイメージング学会 奨励賞
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所属学会 (4件):
日本バイオイメージング学会 ,  日本植物生理学会 ,  日本植物学会 ,  日本建築学会
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