近藤寛子

コンドウヒロコ | Kondo Hiroko X

所属機関・部署：
職名：准教授
競争的資金等の研究課題 (5件)：

論文 (28件)：

Yu Takano, Hiroko X Kondo, Haruki Nakamura. Quantitative evaluation of noncovalent interactions with negative fragmentation approach including basis set superposition error correction. Bulletin of the Chemical Society of Japan. 2024. 97. 9
Hiroko X Kondo, Yu Takano. Structure comparison of heme-binding sites in heme protein predicted by AlphaFold3 and AlphaFold2. Chemistry Letters. 2024. 53. 8
Hiroko X. KONDO, Yu TAKANO. Hydrogen Bond Energies in Helical Peptides Investigated by Negative Fragmentation Approach with Density Functional Theory. Seibutsu Butsuri. 2024. 64. 2. 89-93
Yusuke Kanematsu, Hiroko X. Kondo, Yu Takano. Computational Exploration of Minimum Energy Reaction Pathway of N2O Formation from Intermediate I of P450nor Using an Active Center Model. International Journal of Molecular Sciences. 2023. 24. 24. 17172-17172
Hinako Fujikawa, Hiroko X. Kondo, Yusuke Kanematsu, Yu Takano. Random Forest Classifier of Heme Proteins Using Porphyrin Distortions and Axial Ligands of Heme. Chemistry Letters. 2023. 52. 6. 503-507

MISC (7件)：

近藤寛子, 飯塚博幸, 舛本現, 兼松佑典, 鷹野優. ヘム蛋白質における構造機能相関の解明に向けた蛋白質ポケットとヘムの歪みの相関解析. 日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集. 2021. 21st
鷹野優, 近藤寛子, 近藤寛子, 近藤寛子, 兼松佑典, 兼松佑典, 舛本現. ヘムの構造歪みデータベースおよび解析ツールPyDISHの開発. 日本コンピュータ化学会年会講演予稿集. 2020. 2020
近藤寛子, 兼松佑典, 藤井理則, 石井学, 舛本現, 今田康博, 吉田孝, 鷹野優. ヘムの構造歪みに着目した統計解析・電子状態計算による構造機能相関の解明とデータベースの構築. 生体分子科学討論会講演要旨集. 2019. 46th
Hiroko X. Kondo, Noriaki Okimoto, Makoto Taiji. Improvement of Sampling Efficiency through Combined use of Molecular Dynamics Simulations with Implicit and Explicit Solvent Models. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2013. 104. 2. 170A-171A
Hiroko Kondo, Noriaki Okimoto, Gentaro Morimoto, Makoto Taiji. Exploration of Free-Energy Profiles With Conformational Changes of Proteins. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2010. 98. 3. 26A-26A

講演・口頭発表等 (11件)：

ヘムタンパク質における構造機能相関の解明に向けた構造データの網羅解析
(生物工学会北日本支部シンポジウム 2021)
ヘム蛋白質における構造機能相関の解明に向けた蛋白質ポケットとヘムの歪みの相関解析
(第21回日本蛋白質科学会 2021)
Analysis of an effect of mutations on the structure of CDR-H3 in the anti-HIV neutralizing antibody PG16
(第58回日本生物物理学会年会 2020)
電位依存性カリウムチャネル Kv1.2 における C 型不活性化の分子機構の解析
(凝縮系の理論化学 2019)
電位依存性カリウムチャネル変異体の電位依存的な不活性化機構の解析
(第18回日本蛋白質科学会年会 2018)

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近藤 寛子