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J-GLOBAL ID：201602201403210920   整理番号：16A0368028

ピーナッツゲノム:栽培ピーナッツの2倍体祖先であるArachis duranensisとArachis ipaensisのゲノム配列

The genome sequences of Arachis duranensis and Arachis ipaensis, the diploid ancestors of cultivated peanut

著者 (40件)： BERTIOLI David John (Univ. Brasilia, Brasilia, BRA) ,  VIDIGAL Bruna (Univ. Brasilia, Brasilia, BRA) ,  BERTIOLI David John (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  GAO Dongying (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  ABERNATHY Brian (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  KIM Kyung Do (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  LEAL-BERTIOLI Soraya C M (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  JACKSON Scott A (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  CANNON Steven B (Agricultural Res. Serv., US Dep. of Agriculture, Iowa, USA) ,  FROENICKE Lutz (Univ. California, Davis, California, USA) ,  KOZIK Alexander (Univ. California, Davis, California, USA) ,  MICHELMORE Richard (Univ. California, Davis, California, USA) ,  HUANG Guodong (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LIU Xin (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  XUN Xu (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  FARMER Andrew D (National Center for Genome Resources, New Mexico, USA) ,  DASH Sudhansu (National Center for Genome Resources, New Mexico, USA) ,  UMALE Pooja (National Center for Genome Resources, New Mexico, USA) ,  CANNON Ethalinda K S (Iowa State Univ., Iowa, USA) ,  CLEVENGER Josh (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  OZIAS-AKINS Peggy (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  REN Longhui (Iowa State Univ., Iowa, USA) ,  MORETZSOHN Marcio C (Embrapa Genetic Resources and Biotechnology, Brasilia, BRA) ,  VIDIGAL Bruna (Embrapa Genetic Resources and Biotechnology, Brasilia, BRA) ,  ARAUJO Ana Claudia G (Embrapa Genetic Resources and Biotechnology, Brasilia, BRA) ,  GUIMARAES Patricia M (Embrapa Genetic Resources and Biotechnology, Brasilia, BRA) ,  LEAL-BERTIOLI Soraya C M (Embrapa Genetic Resources and Biotechnology, Brasilia, BRA) ,  SHIRASAWA Kenta (Kazusa DNA Res. Inst., Kisarazu, JPN) ,  ISOBE Sachiko (Kazusa DNA Res. Inst., Kisarazu, JPN) ,  HUANG Wei (Iowa State Univ., Iowa, USA) ,  CHU Ye (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  NIEDERHUTH Chad E (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  SCHMITZ Robert J (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  BUROW Mark D (Texas A&M AgriLife Res., Texas, USA) ,  BUROW Mark D (Texas Tech Univ., Texas, USA) ,  VARSHNEY Rajeev K (International Crops Res. Inst. for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, IND) ,  WANG Xingjun (Shandong Acad. of Agricultural Sci., Jinan, CHN) ,  ZHANG Xinyou (Henan Acad. of Agricultural Sci., Zhengzhou, CHN) ,  BARKLEY Noelle (Agricultural Res. Serv., US Dep. of Agriculture, Georgia, USA) ,  BARKLEY Noelle (International Potato Center, Lima, PER)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 48  号： 4  ページ： 438-446  発行年： 2016年04月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 栽培ピーナッツ(Arachis hypogaea)は,近縁のサブゲノムの異質4倍体で,全サイズが約2.7Gbある。このことは染色体の擬分子のアセンブリを非常に困難なものにしている。そこで,栽培ピーナッツのゲノムを解明するための基礎として,栽培ピーナッツの2倍体祖先であるArachis duranensisおよびArachis ipaensisのゲノム配列を解読したので報告する。これらのゲノムは,栽培ピーナッツのサブゲノムAとBに類似していることが分かり,これらのゲノムを用いて,疾患抵抗遺伝子候補の同定,4倍体の転写物のアセンブル上の指針,栽培ピーナッツのサブゲノム間での遺伝的交換を検出した。A.ipaensisゲノムおよび栽培ピーナッツのBサブゲノムは極めて高いDNA配列の同一性を示し,また生物地理学的な根拠も考慮し,A.ipaensisは,Bサブゲノムを栽培ピーナッツに提供したのと同じ集団の直接の子孫であるだろうと結論する。Copyright Nature Publishing Group 2016

シソーラス用語： *ナンキンマメ ,  *ゲノム ,  栽培 ,  二倍体 ,  *ヌクレオチド配列 ,  *生物進化 ,  四倍体
準シソーラス用語： ピーナッツ

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： ピーナッツ ,  ゲノム ,  栽培 ,  2倍体 ,  Arachis ,  ゲノム配列