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J-GLOBAL ID：201602201510916398   整理番号：15A1352182

遺伝的多様性の研究と完全なミトコンドリアDNAのDループ領域配列に基づくDaweishanミニニワトリの進化【Powered by NICT】

The investigation of genetic diversity and evolution of Daweishan Mini Chicken based on complete mitochondrial DNA D-loop region sequence

著者 (7件)： Jia Xiaoxu (Jiangsu Inst. of Poultry Sci., Yangzhou) ,  Tang Xiujun (Jiangsu Inst. of Poultry Sci., Yangzhou) ,  Lu Junxian (Jiangsu Inst. of Poultry Sci., Yangzhou) ,  Gu Rong (Jiangsu Inst. of Poultry Sci., Yangzhou) ,  Ge Qinglian (Jiangsu Inst. of Poultry Sci., Yangzhou) ,  Gao Yushi (Jiangsu Inst. of Poultry Sci., Yangzhou) ,  Su Yijun (Jiangsu Inst. of Poultry Sci., Yangzhou)
資料名： Nanjing Nongye Daxue Xuebao  (Nanjing Nongye Daxue Xuebao)
巻： 38  号： 4  ページ： 656-660  発行年： 2015年 
JST資料番号： C2367A  ISSN： 1000-2030  CODEN： NNDXEI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]本研究は,雲南省からDaweishanミニニワトリのミトコンドリアDNA(mtDNA)の多様性と起源を評価した。[方法]Daweishanミニ品種に属する合計30名からの血液試料を採取した。Dループの完全なをPCR増幅し,続いて塩基配列を決定した。五赤色野鶏種のDNA配列データは,参照配列として使用するためのGenBankから収集した。生物情報学のデータ解析方法を使用した。[結果]結果は,DaweishanミニニワトリのDループ領域は1231-1 232bpであり,1 231bpハプロタイプは859bp部位内の塩基C欠乏を示した。ヌクレオチド変化の平均係数は5.448であり,ヌクレオチド多様性(Pi)は0.004から43±0.000 14であった,ハプロタイプ多様性(Hd)は0.685±0.079であった。6ハプロタイプを定義した十八の可変部位が観察された。6ハプロタイプは四クレード(クレードA,B,DおよびE)にクラスター化し,のクレードAおよびBが支配的であった。二ハプロタイプはクレードAに属し,二ハプロタイプはクレードBであり,一つはクレードDであり,1haploypeはクレードE.であった。クレードA及びクレードBはGallus gallus spadiceusとクラスターを形成した。[結論]これらの結果は,高ミトコンドリアD-ループの多様性を示し,Daweishanミニ鶏の複数の母性起源を示した。Gallus gallus spadiceusは成形プロセスに大きく寄与していた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： ハプロタイプ ,  品種 ,  *ミトコンドリア ,  塩基 ,  ニワトリ ,  粘土
準シソーラス用語： クレード ,  バイオインフォマティクス ,  GenBank ,  DNA配列 ,  セキショクヤケイ ,  *Dループ ,  雲南省 ,  *D-loop領域 ,  *ミトコンドリアDNA , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 遺伝的多様性 ,  研究 ,  ミトコンドリアDNA ,  Dループ領域 ,  ニワトリ ,  進化