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J-GLOBAL ID：201602202065701668   整理番号：15A1313049

HTLV-1プロテアーゼとインジナビル間の認識の分子動力学シミュレーション【Powered by NICT】

Molecular Dynamics Simulation of the Recognition between HTLV-1 Protease and Indinavir

著者 (5件)： Chang Shan (Inst. of Bioinformatics and Medical Engineering, Jiangsu Univ. of Technol., Jiangsu, Changzhou) ,  Liang Li (Key Lab. of Medicinal and Edible Plants Resources Dev., Chengdu Univ., Chengdu) ,  Liu Wei (Key Lab. of Medicinal and Edible Plants Resources Dev., Chengdu Univ., Chengdu) ,  Hu Jianping (Key Lab. of Medicinal and Edible Plants Resources Dev., Chengdu Univ., Chengdu) ,  Gou Xiaojun (Key Lab. of Medicinal and Edible Plants Resources Dev., Chengdu Univ., Chengdu)
資料名： Hubei Nongye Kexue  (Hubei Nongye Kexue)
巻： 54  号： 12  ページ： 3034-3040  発行年： 2015年 
JST資料番号： C2087A  ISSN： 0439-8114  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ヒトT細胞白血病ウイルス1型(HTLV-1)プロテアーゼ(PR)とその阻害剤インジナビルのcompocindシステム百十一ns分子動力学シミュレーション(MD)を行った。二分子の相互認識は全分子,水素結合,結合自由エネルギーと移動度を調査から分析した。動力学シミュレーション後に,システムは結晶構造と比較してより緩和し続けており,大部分の水素結合がまだ維持されていた。エネルギー分解と自由エネルギー計算の両者は,疎水性相互作用は,HTLV-1PRとインジナビルの会合を促進し,重要な残基は主にR10,L30~V39,V56~F67とW98~I100を含む四領域に分布していた示した。さらに,結合自由エネルギー予測は実験データと良く一致した。インジナビルはflap,top部位の柔軟性とPR系における二エキソサイトを減弱する部分的にのみ,これはなぜインジナビルはHTLV-1PRのそれよりもHIV-1PR阻害能力を有する検討した。研究は受容体構造に基づく抗HTLV-1薬物研究のためのいくつかの構造的および理論的基礎を提供するであろう。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 疎水性相互作用 ,  受容体 ,  水素結合 ,  結晶構造 ,  柔軟性 ,  HIV【ウイルス】 ,  移動度 ,  *プロテイナーゼ
準シソーラス用語： 結合自由エネルギー ,  阻害剤 ,  *分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 稲作  (FC03020C) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

物質索引 (1件)： インジナビル

タイトルに関連する用語 (4件)： HTLV-1 ,  プロテアーゼ ,  インジナビル ,  分子動力学シミュレーション