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J-GLOBAL ID：201602202120674306   整理番号：16A0235231

Peltigera membranaceaのメタゲノム解析は地衣類関連細菌がリン酸可溶化に関与することを示唆する

Analysis of the Peltigera membranacea metagenome indicates that lichen-associated bacteria are involved in phosphate solubilization

著者 (5件)： SIGURBJOERNSDOTTIR M. A. (Univ. Akureyri, Akureyri, ISL) ,  SIGURBJOERNSDOTTIR M. A. (Univ. Iceland, Reykjavik, ISL) ,  ANDRESSON Olafur S. (Univ. Iceland, Reykjavik, ISL) ,  VILHELMSSON Oddur (Univ. Akureyri, Akureyri, ISL) ,  VILHELMSSON Oddur (Univ. Iceland, Reykjavik, ISL)
資料名： Microbiology  (Microbiology)
巻： 161  号： 5  ページ： 989-996  発行年： 2015年05月 
JST資料番号： E0043A  ISSN： 1350-0872  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アイスランドの植生において普通に見られる葉状地衣類Peltigera membranaceaに関与する非光合成細菌叢に焦点を当て,その役割についてメタゲノム解析法を用いて調べた。収集した地衣類の葉状体からメタゲノムライブラリを構築し,系統発生学的多様性と機能的遺伝子組成の観点から細菌叢のDNA配列を解析した。プロテオバクテリア集団ではαプロテオバクテリアが優勢で70%を占め,βプロテオバクテリア,γプロテオバクテリアとδプロテオバクテリアがそれに続いた。P.membranaceaのメタゲノム由来の約30000のコンティグを,BLASTXアルゴリズムを用いて蛋白質データベースと比較した。その結果,リン酸代謝に関与する酵素の存在を示唆する1335のコンティグが,データセットにおいて見いだされた。主にαプロテオバクテリアに属し,共生菌におけるリン酸可溶化の重要性を裏付ける結果を得た。

シソーラス用語： *地衣類 ,  *遺伝学 ,  遺伝子ライブラリー ,  *細菌 ,  ミクロフローラ ,  アイスランド共和国 ,  リン酸 ,  可溶化 ,  系統発生 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： DNA配列 ,  *Peltigera membranacea ,  αプロテオバクテリア ,  メタゲノムライブラリー ,  *メタゲノム解析 ,  *共生細菌

分類 (3件)： 微生物生理一般  (EG03051L) ,  異種生物間相互作用  (EE01050A) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： メタゲノム解析 ,  地衣類 ,  細菌 ,  リン酸 ,  可溶化