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J-GLOBAL ID：201602206095833114   整理番号：16A0157921

ホスホプロテオーム解析のための高濃度トリプシン支援高速ゲル内分解【Powered by NICT】

High Concentration Trypsin Assisted Fast In-Gel Digestion for Phosphoproteome Analysis

著者 (4件)： Liu Fangjie (Key Lab. of Separation Sci. for Analytical Chemistry, Dalian Inst. of Chemical Physics,Chinese Acad. of Sciences, Dalian) ,  Ye Mingliang (Key Lab. of Separation Sci. for Analytical Chemistry, Dalian Inst. of Chemical Physics,Chinese Acad. of Sciences, Dalian) ,  Pan Yanbo (Key Lab. of Separation Sci. for Analytical Chemistry, Dalian Inst. of Chemical Physics,Chinese Acad. of Sciences, Dalian) ,  Zou Hanfa (Key Lab. of Separation Sci. for Analytical Chemistry, Dalian Inst. of Chemical Physics,Chinese Acad. of Sciences, Dalian)
資料名： Fenxi Huaxue  (Fenxi Huaxue)
巻： 43  号： 10  ページ： 1452-1458  発行年： 2015年 
JST資料番号： C2394A  ISSN： 0253-3820  CODEN： FHHHDT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ポリアクリルアミドゲル電気泳動は強力な蛋白質分離技術である。質量分析と組み合わせて,プロテオミクス分析で1000の蛋白質を同定できた。しかし,時間がかかることはプロテオミクス研究におけるその適用を制限している。本研究では,高濃度トリプシンでゲル内消化後のホスホペプチド濃縮を低下させなかったが,ゲル内分解を促進することが分かった。従って,新しい,高速でロバストな消化方法を確立した。最初に,50~HeLa細胞蛋白質はSDS-PAGEにより5画分に分離し,蛋白質は30分の高濃度トリプシンにより加水分解した。最後に,ホスホペプチドを,Ti IMACチップによって濃縮された。LC-MS/MS解析後,約2000のリン酸化部位は,実験グループにおいて同定された,1500未満の対照群において同定されたフォスフォーライオン部位であった。高濃度trypsin,inゲル消化を用いてわずか30分以内に完了することができ,より多くのリン酸化部位の同定および対照と比較して誤った開裂の低い比率は得られたが,これは高濃度のトリプシンはゲル内消化を加速するだけでなく,ホスホプロテオームのカバー度を改善することを示した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： タンパク質 ,  *高速度 ,  チタン ,  消化 ,  *ゲル ,  SDS-PAGE ,  プロテオミクス ,  *トリプシン
準シソーラス用語： リン酸化部位 ,  LC/MS/MS ,  金属アフィニティークロマトグラフィー ,  ホスホペプチド ,  ポリアクリルアミドゲル電気泳動 ,  *高濃度 ,  *ホスホプロテオーム , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (7件)： ホスホプロテオーム ,  解析 ,  高濃度 ,  トリプシン ,  支援 ,  ゲル ,  分解